內源siRNA通路調控藍氏賈第鞭毛蟲分化的分子機制研究

《內源siRNA通路調控藍氏賈第鞭毛蟲分化的分子機制研究》是依託中山大學，由廖建友擔任項目負責人的青年科學基金項目。

基本介紹

• 中文名：內源siRNA通路調控藍氏賈第鞭毛蟲分化的分子機制研究
• 項目類別：青年科學基金項目
• 項目負責人：廖建友
• 依託單位：中山大學

中文摘要

內源siRNA是近年來在真核生物中發現的一種重要小RNA，它參與維持基因組穩定性，發育調控及抗逆反應等多種重要生命活動。目前對於內源的siRNA的功能和調控機制的研究還處於起步階段。藍氏賈第鞭毛蟲（賈第蟲）作為一種最原始的真核生物，是一種重要研究模型。申請人在前期研究中通過賈第蟲小RNA的高通量測序數據分析，內源siRNA加工相關蛋白GLDICER的沉默實驗和內源siRNA結合蛋白GLAGO的免疫共沉澱實驗證實了賈第蟲中存在內源siRNA。我們發現內源siRNA在賈第蟲分化過程中表達逐漸上調，並且沉默GLDICER阻礙了賈第蟲分化，提示賈第蟲內源siRNA通路參與賈第蟲的分化調控。本項目將在前期研究基礎上，結合高通量測序和多種體內和體外實驗技術確定調控賈第蟲分化的內源siRNA及其直接靶標，闡明內源siRNA通路調控賈第蟲分化的分子機制，為真核生物內源siRNA功能和進化研究提供新線索。

結題摘要

賈第蟲是一種最原始的病原單細胞真核生物，它的細胞分化能在體外誘導完成，非常便於研究分化過程中細胞的生理生化變化。我們大規模測了賈第蟲分化過程中的小RNA轉錄組和長RNA轉錄組。通過對賈第蟲RNA轉錄組的系統分析以及後續的實驗驗證，我們在賈第蟲中首次鑑定到了2種內源siRNA和6種tRNA來源小RNA，以及376個新的賈第蟲lncRNA。2種內源siRNA分別來自賈第蟲端粒區轉座子和基因組中的三個小RNA編碼區。我們發現所有我們鑑定到的小RNA在賈第蟲分化過程中都是上調的，這說明這些小RNA可能參與賈第蟲的分化過程的調控。通過對內源siRNA產生所必須的蛋白Dicer的沉默，我們發現賈第蟲的分化能力受到削弱，這證明了內源siRNA確實可能參與了賈第蟲的分化和表面抗原過程調控，進一步分析確認siRNA可能通過靶向Bestatin等蛋白來影響賈第蟲分化。以上成果目前已發表在SCI收錄的Proc. Nat. Acad. Sci.和 BBA-Mol. Cell Res.雜誌上。由於所取得成果的重要性，我們還受邀在Springer出版社出版的“Non-coding RNA and inter-kingdom communication”一書中與人合作撰寫了一章來介紹該項目所取得的研究成果。