內棲動物(infauna,endofauna)是指生活於水底沉積物之內而非在其表面的動物;內棲動物藉挖掘器官掘穴生活或分泌黏性物質形成管子穴居其中,也有在岩礁或木材上穿孔而穴居其內。 內棲動物有多毛類、雙殼類、腹足類、甲殼類、棘皮動物、腸鰓類等。