基本介紹
圖書目錄,第1章,第2章,第3章,第4章,書摘,
圖書目錄
第1章
緒論
1.1 免疫信息學是一門新興交叉學科
1.2 免疫信息學研究的基本問題
1.3 免疫信息學研究的基本方法
1.3.1 資料庫構建方法
1.3.2 計算與統計學方法
1.3.3 數學建模與計算機模擬方法
1.4 免疫信息學的套用
1.4.1 系統免疫學理論與人工智慧研究
1.4.2 疫苗研發與傳染病研究
1.4.3 實驗與臨床免疫學研究
參考文獻
第2章
免疫生物學基礎
2.1 免疫應答
2.1.1 天然免疫
2.1.2 適應性免疫
2.2 免疫系統的組成與結構
2.2.1 免疫器官
2.2.2 免疫細胞
2.2.3 免疫分子
2.3 免疫系統的機制
2.3.1 抗原
2.3.2 免疫系統的特異性識別
2.3.3 免疫記憶與免疫耐受
2.4 免疫監督
2.5 免疫效應及其調節機制
2.5.1 免疫效應
2.5.2 免疫調節
2.6 免疫系統的複雜性特徵
2.6.1 複雜性適應系統
2.6.2 免疫系統的自組織
2.6.3 免疫系統網路
2.7 小結
參考文獻
第3章
免疫系統模建
3.1 淋巴細胞的免疫識別與增殖動力學
3.1.1 T、B淋巴細胞受體庫大小估計
3.1.2 淋巴細胞增殖與分化的克隆模型
3.2 獨特型網路與免疫應答
3.2.1 獨特型網路與免疫記憶
3.2.2 獨特型網路與免疫耐受
3.3 免疫系統的調節
3.3.1 免疫相關細胞的分子調控網路
3.3.2 免疫應答的細胞調節
3.3.3 宿主免疫應答的系統水平的調節
3.4 小結
參考文獻
第4章
信息學資料庫
4.1 資料庫概念
4.2 免疫信息學資料庫
4.2.1 簡介
4.2.2 基於網路的免疫信息學公共資料庫利用
4.2.3 免疫多態性資料庫(IPD)
4.2.4 SYFPEITHI
4.2.5 IMTECH免疫信息學資料庫
4.2.6 抗原決定簇資料庫(IEDB)
4.3 數據挖掘與知識發現
4.3.1 數據挖掘在免疫信息學中的作用
4.3.2 數據挖掘在免疫信息學中的套用步驟
4.3.3 短肽預測的數據挖掘實例
參考文獻
第5章 B細胞表位的預測
第6章 T細胞表位的預測
第7章 抗原處理與TAP轉運預測
第8章 感染性疾病的傳播動力學及免疫流行病學模型
第9章 抗病毒疫苗研究
第10章 反向疫苗學在抗細菌疫苗中的套用
第11章 免疫信息學在抗原蟲病疫苗研發中的套用
第12章 抗蠕蟲疫苗研發
第13章 免疫信息學和抗腫瘤疫苗的研發
第14章 生物信息學在抗自身免疫病疫苗研發中的套用
第15章 免疫信息學在實驗與臨床免疫學中的套用
附錄A
附錄B
書摘
第1章 緒論
1.1 免疫信息學是一門新興交叉學科
免疫信息學（immunoinformatics．）是建立在現代免疫學和信息學基礎上的一門新的交叉學科，是運用信息學的理論和方法解決免疫學及疫苗學問題的學科，也是研究免疫系統調控和免疫應答過程中信息傳遞規律的科學。immunoinformatics一詞由以色列魏茨曼研究所的已故著名的套用數學家、數學生物學家和理論免疫學家Lee A．Segel於2001年提出，最初用來描述免疫系統中由細胞信號分子如細胞因子、趨化因子等介導的調控作用機制，其中的信息學含義與信號傳送與傳遞等性質相似。此後，一些生物信息學者、疫苗學者以及免疫學者對免疫信息學概念的內涵和外延進行了拓展，並被人們所接受。嚴格說來，要給免疫信息學一個非常具體的學科界定和教科書式的闡釋是比較困難的，這主要是由於免疫信息學與相關的一些新興學科有著密切的聯繫。
我們知道，20世紀90年代以來，由於多學科理論與技術（如高通量測序及生物晶片等技術）的進展與突破，各種組學（如基因組學、蛋白質組學及代謝組學等）蓬勃發展，給科學界提供了海量的生物學基礎數據。人們相信這些通過還原論方法和技術（以分子生物學技術為主流）獲得的生物學數據深刻而又複雜，必須採用綜合論方法與技術對其進行闡釋；而綜合論方法則是以資訊理論方法為基礎的，它利用信息技術分析大量的生物數據，從中發掘出生物學的一般原理，並試圖通過各個生物組成部分的研究推導出系統行為。……
