位相問題phase problem，是指晶體結構解析中晶胞內原子位置的(全部)確定。
位相問題需以晶體電子密度函式P為依據，而N函式的傅立葉合成則需以掌握結構因子數組Fnkf:為前提。但迄今除少數研究探索用多光束法測定含位相的結構因子Fn,}r -', }, }r ' e}w'}k‘外，一般用照相法或用x射線光量子計數法在實驗上只能由經修正後所得衍射絕對強度Ihkf中導出結構因子模值}f'}hk7 } } Ihk，一}}'"hki2)而不能直接由實驗獲得位相}hz‘的信息，從而使P函式的計算發生原則性的困難。這一問題稱作位相問題。如何解決結構因子位相是X射線晶體結構分析學科的核心與精華所在。
