中國近海典型海域BALOs的生態學研究

中國近海典型海域BALOs的生態學研究

《中國近海典型海域BALOs的生態學研究》是依託華僑大學,由陳明霞擔任項目負責人的青年科學基金項目。

基本介紹

  • 中文名:中國近海典型海域BALOs的生態學研究
  • 項目類別:青年科學基金項目
  • 項目負責人:陳明霞
  • 依託單位:華僑大學
項目摘要,結題摘要,

項目摘要

BALOs(Bdellovibrio and like organisms)是一類專門以捕食細菌(多為G-菌)為生的寄生性細菌,在細菌種群調控、病原菌的防治及水質的淨化等方面具有重要的作用。近年來的研究發現海洋中存在種類繁多的BALOs,其種類多樣性及數量都遠遠超出人們原有的認識,其生態分布及功能亟待深入研究。本項目擬運用傳統的分離培養方法、分子方法及高通量測序等方法,分析中國近海典型海域中BALOs的種類組成、數量分布;結合多元混合微生物群落體系模擬培養等方法開展BALOs與其他宿主細菌之間的相互關係研究。通過本項目的實施,可望闡明近海典型海區海洋BALOs的種類組成及數量分布特徵,探討海洋BALOs對海洋宿主細菌的種類和數量的調控作用,為完善 “微食物環”理論及闡釋BALOs的生態功能提供理論依據;完善蛭弧菌的系統發育分類學研究,獲取具有生物防治價值的海洋BALOs新種質資源。

結題摘要

本項目關於中國近海典型海域BALOs的種群特性及分布研究。 (1)從海水中分離獲取84株海洋細菌,並完成分子鑑定工作,歸為26屬,38種,其中61.9%屬於alpha-proteobacteria類群,23.8%屬於gamma-proteobacteria類群,11.9%屬於Actinobacteria_c類群,2.4%屬於Flavobacteria類群。菌株27-11,27-7,27G-34,27-10,27G-7的16S rDNA序列同源性小於或等於97%,可能為新的物種。這些物種類群覆蓋度較廣,具有一定代表性,皆為海源型土著微生物,為後續蛭弧菌的裂解譜測定及套用研究奠定了物種基礎,有助於研究蛭弧菌的裂解特性並篩選出環境友好型的宿主。 (2)完成BALOs7,8,9,10,11,28、HLS和Y22蛭弧菌的分子鑑定工作,BALOs7,8,9,10,11,28和Y22之間的16S rDNA同源性高於98%,與Halobacteriovorax litoralis JS5(T) 具有92.4%的序列同源性,是一個全新的物種,命名為Halobacteriovorax vibrionivorans。其基因組已經測序完成,大小為 3,153,210 bp, GC含量為 35.84 mol%,預測到3047基因,其中 3009是蛋白編碼基因, 6個rRNAs 組成兩個操縱子, 32個 tRNA基因,分別有1910 和 1255 個蛋白基因可以比對上COG/KOG/NOGs數據和KEGG資料庫。HLS與Halobacteriovorax marinus SJ(T)具有98.1%的16S rDNA同源性。菌株BALOs7、BALOs9 、Y22、HLS和LF TCBS 15的GenBank登錄號分別為CP027772、QDKL00000000、SGIQ00000000、QOCL00000000和SBIG00000000。所獲取的種質和基因資源不僅為蛭弧菌類群的系統發育分析、捕食機制的探索具有重要的理論價值,同時在微生物防控方面也具有巨大的套用潛力。 (3)採用高通量測序及16S rDNA克隆文庫法,完成對廈門海域海水蛭弧菌生態分布的調查,確定水域中存在未培養的蛭弧菌類群。這些類群屬於低豐度類群,比值小於0.015%。說明蛭弧菌在微生物生態調控中可能扮演著極其特別的調控作用,並為

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