中國經濟特區立法研究所成立於2009年6月，依託北京師範大學珠海分校，由時任北京師範大學珠海分校黨委副書記、法律與行政學院院長於風政教授任主任。
中國經濟特區立法研究所成立之時，正值澳門大學在珠海市橫琴島建立校區、全國人大行將通過法律授權澳門特別行政區依照澳門法律對澳大橫琴校區進行管轄一事引發憲法學界廣泛爭議之時。中國特區立法研究所順勢舉辦了“珠海橫琴島開發中的法律問題”省內專家研討會，向中央政府和教育部提交了《關於設立“珠海高等教育改革特別試驗區”，利用澳門大學搬遷橫琴的契機，推動珠三角地區高等教育改革與創新的研究報告》；提交了關於全國人大常委會授權澳門特別行政區以澳門法律管轄澳大橫琴校區的法律意見書等等，認為全國人大常委會授權澳門特別行政區以澳門法律管轄澳大橫琴校區的決定不合憲法、不合澳門特區行政區基本法，並產生過重大的政策性影響。
2011年，中國經濟特區立法研究所向珠海市人大常委會提交了關於儘快制定《珠海市水域管理條例》以應對澳門提出劃分海域請求的建議；關於建立“珠澳合作與發展促進會”的建議；《關於制定<珠海市業主委員會組織條例>的建議》等等，後來的發展證明，這些建議都極有預見性，為推動社會治理髮展提供了前瞻性政策設計。
中國經濟特區立法研究所設立以來，先後承擔數十項科研項目和橫向課題，經費達到數百萬元，成為立足珠海，服務全省的學術科研重鎮。
