中國工程科技發展戰略福建研究院作為院省共建的工程科技區域高端智庫，將以發揮院士作用為核心、以項目研究為紐帶，團結和帶領創新團隊，促進產學研用深度融合，組織開展諮詢調研、學術交流、院士行、人才培養等活動，旨在以科學研究支撐科學決策、促進科學發展，推動工程科技服務經濟社會發展。
根據共建協定，福建研究院是公益性、諮詢性學術研究機構，是院省共建的工程科技區域高端智庫。福建研究院以發揮院士作用為核心，促進產學研用深度融合。以項目研究為紐帶，組織開展諮詢調研、學術交流、院士行、人才培養等活動。福建研究院的主要任務包括：為福建及區域經濟社會發展中重大工程科技問題、戰略規劃等提供服務；為福建各行各業的產業升級、技術改造做好諮詢服務工作；圍繞工程科技領域前沿，組織開展學術交流、人才培養、科技服務和國際合作等活動；為福建省發現、培養和引進工程科技發展戰略領域的科技人才服務；為促進福建及區域內工程科技和科學發展的理念傳播服務；完善科技成果轉移轉化平台，促進產學研用深度融合，推動一批技術領先、具有明顯競爭優勢、綠色環保的項目在福建落地。
項目負責人均由院士擔任，項目研究周期從1年至2年，項目結題後認為有必要繼續進行研究的任務，可繼續深化研究。研究成果經福建省與中國工程院協商共同向社會發布。研究成果套用主要針對福建省重大需求，供有關部門決策參考，同時供福建省或中國工程院開展同類諮詢項目研究時參考。在項目研究成果的基礎上，形成研究報告和政策建議，以福建省政府、中國工程院雙方的名義向國家或有關部門呈報。
