“嘌呤型”或嘌呤-嘌呤-嘧啶型（R·RY）三螺旋中，第三條嘌呤鏈以反平行於Watson-Crick雙螺旋嘌呤鏈的方向纏繞到雙螺旋的大溝上，專一性地與嘌呤鏈結合。例如，典型的R·RY型三螺旋G·GC和A·AT，其相應的結構單元三鹼基體（圖3-26）；其專一性體現在G對GC、A對AT的識別。
基本介紹
- 中文名：“嘌呤型”三螺旋DNA
- 外文名：The purine type three spiral DNA
- 變化部位：扭轉角和X位移
- 方式：反平行
- 典型的：R·RY型三螺旋等
- 特性：專一性等
研究結果,類型,
研究結果
早期，在利用光譜學和超分離測量方法探索三鏈複合物時發現了G·GC和I·IC兩種R·RY型三螺旋。後來，Fresco等用親和色譜法確認R·RY型三螺旋中也包括A·AU∕I、I·AU∕T和I·GC三螺旋。隨後，又確認了G·GC、A·GC和T·AT 3種典型的R·RY型三螺旋，以及C·AT、A·GC和T·CG等相互作用較弱的三螺旋。研究發現R·RY型三螺旋（C·AT、A·GC和A·AT等）第三條嘌呤鏈和Watson-Crick雙螺旋的嘌呤鏈以兩個反-Hoogsteen氫鍵相連線，且糖環的二面角限制在anti區。
類型
核磁共振實驗在研究R·RY型、內含一個T·CG三鹼基體的G·GC三螺旋（Karen, 1994）時，發現所有的糖環構象包括T·CG的轉化位點，均採取接近於C2′-endo的堆積形式。在三螺旋中，C2′-endo的糖環構象在每一條鏈上的分布按下列順序增加：嘧啶型<雙螺旋的嘌呤鏈<第三條嘌呤鏈。從目前的情況看，有關糖環構象以及R·RY型三螺旋整體結構尚需詳細研究。
在R·RY型三螺旋中，第三條核苷酸鏈的加入引起了扭轉角和X位移的變化。結果顯示，此三螺旋既不同於通常的A型也不同於B型DNA。雙螺旋的鹼基對向小溝方向移動了約19nm(原文為"-19nm"疑為"波浪線19nm")，以此來容納大溝上的第三條鏈（圖3-27）。總之，三螺旋中的雙螺旋區似乎並未受到第三條鏈太大的影響，而且雙螺旋區的鹼基堆積形式有些像A型DNA。然而與A型DNA不同的是雙螺旋區的大部分核苷酸的糖環構象是S型而非N型，R·RY型三螺旋的詳細結構仍需進一步研究。
