基本介紹
- 中文名：dNTP
- 外文名：deoxy-ribonucleoside triphosphate
- 別稱：脫氧核糖核苷三磷酸
- 地位：生物DNA合成中
簡介,嘌呤,嘧啶,DNA結構,氫鍵,形成DNA骨幹,儲存液,使用濃度,
簡介
dNTP代表脫氧核糖核苷酸三磷酸。每個dNTP由磷酸基團，脫氧核糖和含氮鹼基組成。有四種不同的dNTP，可分為兩組：嘌呤和嘧啶。
嘌呤
dATP（脫氧腺苷5'-三磷酸）和dGTP（脫氧鳥嘌呤5'-三磷酸）構成嘌呤。
腺嘌呤和鳥嘌呤是嘌呤中的基質，都具有雙環結構。
嘧啶
dTTP（脫氧胸苷5'-三磷酸）和dCTP（脫氧胞苷5'-三磷酸）構成嘧啶。
胸腺嘧啶和胞嘧啶是嘌呤中的特徵，它們都具有單環結構。
DNA結構
DNA的雙螺旋結構由dNTP組成，非常類似於聚合物中的單體單元。如果你解開DNA並想像它是一個階梯，磷酸基團與脫氧核糖糖基團交替組成梯子的兩側，（只有“糖磷酸骨架”這個詞），鹼基會形成梯子的梯級。DNA的一個重要特徵是兩個鹼基通過氫鍵連線形成一個梯級。這種結合將兩條DNA鏈保持在一起。嘧啶類不能配對，嘌呤也不能配對。鹼基配對只能在TA或GC之間進行。這是由Erwin Chargaff發現的。在他的實驗中，他從細胞核中提取DNA並記錄存在的四種核苷酸的量。他發現T的百分比總是等於A的百分比。在G和C之間發現了相同的關係。他還發現A或T的百分比加上G或C的百分比加到100%。這些發現極大地幫助了沃森，克里克，富蘭克林和威爾金斯。
氫鍵
G和C鹼基之間存在三個氫鍵，但A和T鹼基之間僅有兩個氫鍵。
A和T之間只有兩個形式，因為腺嘌呤鹼基的碳2比其附著的氫具有更少的電負性，因此不會在其上產生δ負電荷，這意味著胸腺嘧啶的碳2上的氧不能與其形成氫鍵。氫。
因此，這意味著需要更多的熱能來使DNA變性，這比富含AT的DNA更富含GC。
形成DNA骨幹
如前所述，DNA的主鏈由交替的磷酸和脫氧核糖基團組成。在dna的一條鏈上的相鄰核苷酸之間形成的鍵是磷酸二酯鍵。當一個脫氧核糖的5'或3'碳原子與第一個磷酸上的氧鍵合時形成。這是從每個核苷酸中除去二磷酸的縮合反應。這就是為什麼DNA中發現的核苷酸實際上是dNMPs（脫氧核糖核苷酸單磷酸酯）。
參與DNA的合成
參與DNA的合成儲存液
dNTP溶於pH為7.0的NaOH貯存液中，最初的貯存液可稀釋到10mol/L，分裝後存放在-20℃冰櫃中。dNTP使用濃度在20～200 μmol/L之間。4種dNTP必須等濃度配合以減少錯配誤差。
使用濃度
在PCR反應中,使用低dNTP濃度,可減少非靶位置啟動和延伸時的核苷酸錯誤摻入。一般可根據靶序列的長度和組成來決定最低dNTP濃度。例如在100μl的反應體系中,4種dNTP的濃度為20μmol/L,可基本滿足合成2.6μg DNA或10pmol/L的400bp序列。
