《XLRP新致病基因的定位與克隆》是依託中山大學,由黎仕強擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名:XLRP新致病基因的定位與克隆
- 項目類別:面上項目
- 項目負責人:黎仕強
- 依託單位:中山大學
中文摘要,結題摘要,
中文摘要
視網膜色素變性是常見的遺傳性致盲眼病,具有高度遺傳異質性,其中X連鎖遺傳視網膜色素變性(XLRP)發病早、症狀最為嚴重。迄今已發現6個XLRP相關位點,並已確定兩個致病基因,更多的基因有待定位克隆。我們收集了20個XLRP家系和22個家系遺傳方式不明確( 可能為XLRP或常染色體隱性遺傳RP)家系,前期研究發現4個XLRP家系由RPGR突變所致、2個遺傳方式不明確的家系由RP2突變所致。在此基礎上,我們擬通過X染色體基因組連鎖定位分析和核酸序列分析,以及全外顯子組測序技術,定位克隆XLRP新基因。結果不僅有助於揭示XLRP病因與分子機制,同時為開展常見致盲眼遺傳病出生缺陷的監測奠定基礎。
結題摘要
視網膜色素變性是常見的遺傳性致盲眼病,具有高度遺傳異質性,其中X連鎖遺傳視網膜色素變性(XLRP)發病早、症狀最為嚴重。迄今已發現6個XLRP相關位點,並已確定兩個致病基因,更多的基因有待定位克隆。在基金的資助下,本研究對XLRP家系的先證者進行全外顯子組測序,同時結合連鎖定位區域篩選出了一些可能的致病變異位點,並對這些位點進行驗證,未找到明確的XLRP發病高風險位點,因此對後續研究進行了調整:通過對157例視網膜色素變性(RP)先證者進行全外顯子組測序分析,我們發現了一批視網膜色素變性家系攜帶X染色體性連鎖基因的半合突變,其中8個為新突變,擴展了中國人群視網膜色素變性在已知X染色體連鎖致病基因上的突變頻譜和頻率;在6個最初診斷為視網膜色素變性的家系中發現有非典型無脈絡膜症致病基因CHM的致病突變,這些患者的表型與先前報導在高加索人群中無脈絡膜症的患者表型並不相同,該研究揭示不同致病基因導致重疊的表型和非典型的表性差異給臨床診斷提供了幫助;在兩個視網膜色素變性家系發現X染色體CACNA1F基因突變,該基因之前報導突變導致先天性靜止性夜盲和錐桿細胞營養不良,本研究首次在視網膜色素變性患者中發現該基因突變,該研究提示同一基因不同的致病突變導致不同嚴重程度的表型。另外,我們還在11個初診均診斷為LCA或早發重型錐細胞營養不良(CORD)先證者中發現13個ALM S1無效突變,提示ALMS1基因應作為早發嚴重視網膜變性的候選基因,眼部表型異常可能是綜合徵的早期表現。通過本研究,為該病基因診斷及防治提供了依據。相關的4篇研究論文正在整理投稿中。