MFS家族膜轉運蛋白轉運機理的研究

《MFS家族膜轉運蛋白轉運機理的研究》是依託清華大學,由龔海鵬擔任項目負責人的面上項目。

基本介紹

  • 中文名:MFS家族膜轉運蛋白轉運機理的研究
  • 依託單位:清華大學
  • 項目負責人:龔海鵬
  • 項目類別:面上項目
項目摘要,結題摘要,

項目摘要

MFS家族是已知最大的一個膜轉運蛋白家族,參與多種必要的生理活動。理解MFS家族轉運蛋白的轉運機理是非常重要的。根據目前的理論,MFS家族轉運蛋白通常在兩種主要構象間切換。這兩種構象分別為面向細胞外開放和面向細胞內開放的構象,分別用於攝取和釋放被轉運物質。已知結構的MFS家族蛋白多為向內開放的構象。岩藻糖轉運蛋白FucP(fucose permease)是數月前剛解析出結構的MFS家族成員。FucP同時轉運L-fucose和質子。由於FucP具有向外開放的構象,這一結構有助於人們理解MFS家族蛋白的機理。本項目計畫由FucP的晶體結構出發,使用分子動力學模擬技術,根據理論計算和分析,結合生化實驗,研究FucP的分子轉運機理,即FucP是如何通過構象變化完成對質子和L-fucose的共轉運。另外,本項目還計畫研究造成FucP底物選擇性的分子機理。

結題摘要

MFS家族是已知最大的一個膜轉運蛋白超家族,參與多種必要的生理活動。因此,深入理解MFS家族轉運蛋白的轉運機理非常重要。目前廣泛認為,MFS家族轉運蛋白通常在兩種主要構象間切換。這兩種構象分別為面向細胞外開放和面向細胞內開放的構象,分別用於攝取和釋放被轉運物質。岩藻糖轉運蛋白FucP(fucose permease)是MFS家族成員中第一個解析出對胞外開放構象的蛋白。該蛋白共轉運質子和L型岩藻糖(L-fucose),並利用前者的電化學梯度完成後者在細胞內的積累。本項目中,我們使用分子動力學模擬技術研究FucP的分子機理。根據計算機模擬和相關理論計算,結合生化實驗結果,我們發現FucP利用了一個酸性殘基Glu135偶聯質子結合和蛋白構象變化。具體而言,Glu135結合質子後,可以觸發FucP從對胞外開放構象轉化為對胞內開放構象,從而完成對質子和L-fucose的共轉運。另外,本項目還研究了MFS家族另外兩個成員木糖轉運蛋白XylE(xylose transporter)和葡萄糖轉運蛋白Glut1(glucose transporter)的工作機理。

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