Cytoscape是一款圖形化顯示網路並進行分析和編輯的軟體,見圖1,它支持多種網路描述格式,也可以用以Tab制表符分隔的文本文檔或Microsoft Excel檔案作為輸入,或者利用軟體本身的編輯器模組直接構建網路。
基本介紹
- 中文名:CytoScape
- 意思:分析和編輯的軟體
- 價格:免費
- 工作平台:pc
Cytoscape是一款圖形化顯示網路並進行分析和編輯的軟體,見圖1,它支持多種網路描述格式,也可以用以Tab制表符分隔的文本文檔或Microsoft Excel檔案作為輸入,或者利用軟體本身的編輯器模組直接構建網路。
12.cytoscape:用於網路建模的一個基於社區的框架 13.用語義數據集成和知識管理表示生物網路相關性 14.複雜的、多數據類型及多工具分析的解決方案:運用工作流程與流水線方法的原則及套用 第三部分:套用 .15.高通量sirna篩選結合化合物...
的差異表達基因進行了研究,發現在翅脫落的高峰期,很多基因高度上調,基於WGCNA分析,141,456個功能基因中21,922個差異表達基因被劃分為18個差異表達模組,並且我們隊其中與落翅表型高度相關的模組進行了進一步的STEM和CYTOSCAPE研究,並...
3. 分析了蛋白質結構域信息、同源信息、亞細胞定位信息等與蛋白質的關鍵性之間的關係,提出了一系列基於多元信息融合的關鍵蛋白質識別方法;4. 提出了基於隨機遊走和集成多數據源信息的疾病基因預測方法;5. 開發了基於Cytoscape的關鍵蛋白...
7.4.1 Cytoscape基礎 133 7.4.2 將數據導入Cytoscape 134 7.4.3 視覺特性 135 7.4.4 Apps選單 139 7.5 yEd 139 7.6 小結 141 第8章 輕量級編程 143 8.1 Python 143 8.1.1 上手 143 8.1.2 清洗數據 144...
4.5.5 Cytoscape 89 4.5.6 Pajek 89 4.5.7 FANMOD 89 4.5.8 POINeT 89 4.5.9 Osprey 90 4.5.10 BioLayout Express3D 90 4.6 小結 90 參考文獻90 第5章 由進化論構建網路的方法 94 5.1 用DD方法研究生物網路的...
12.Cytoscape:用於網路建模的一個基於社區的框架 13.用語義數據集成和知識管理表示生物網路相關性 14.複雜的、多數據類型及多工具分析的解決方案:運用工作流程與流水線方法的原則及套用 第三部分:套用 15.高通量siRNA篩選結合化合物篩選...