《28s rRNA 5'末端衍生小RNA分子生成機制及生物學功能研究》是依託天津醫科大學，由李帥擔任項目負責人的青年科學基金項目。
基本介紹
- 中文名：28s rRNA 5'末端衍生小RNA分子生成機制及生物學功能研究
- 項目類別：青年科學基金項目
- 項目負責人：李帥
- 依託單位：天津醫科大學
中文摘要,結題摘要,
中文摘要
隨著高通量測序技術在小RNA研究領域中的廣泛套用，新小RNA不斷出現，小RNA的來源亦不斷得到拓展。既往研究表明rRNA可產生大量小RNA分子，但這些小RNA的產生機制及功能尚不清楚。本課題組前期研究發現rRNA衍生小RNA具有特殊的來源分布模式，即小RNA主要來自rRNA末端，其中以28s rRNA 5’末端衍生小RNA最為豐富，且這類rRNA末端衍生小RNA（rRNA-terminal-derived small RNA，rtsRNA）與過氧應激相關並具有與miRNA類似的調控功能。據此，本課題擬探索以下問題：（1）rtsRNA在乳腺癌組織、癌旁組織中的表達及其與患者預後的關係；（2）rtsRNA的加工生成機制；（3）rtsRNA調控的下游靶基因及其生物學功能。本課題的完成，將深化我們對“rRNA降解過程具有主動生物學調控意義”的認識，同時擴展我們對小RNA來源及調控功能的認識。
結題摘要
本研究項目以一類新發現的rRNA末端衍生小RNA（rRNA-terminal-derived small RNA，rtsRNA）為研究對象，研究其表達模式、分子生成機制及生物學功能。通過對不同人體組織來源小RNA深度測序數據分析發現，細胞內大量小RNA來源於核糖體RNA，且呈現rRNA末端來源規律，尤以28s rRNA 5’末端來源小RNA表達最為豐富。通過分析Dicer、Dgcr8（miRNA生成通路兩個關鍵基因）敲除小鼠細胞小RNA深度測序數據，我們發現rtsRNA的生成不依賴於miRNA加工生成途徑。此外，通過分析Ago2結合小RNA深度測序數據（RIP-sequencing）發現Ago2不結合rtsRNA，即rtsRNA並不通過RISC複合物發揮調控功能。利用雙氧水等過氧刺激哺乳動物細胞系會顯著誘導rtsRNA的表達。利用RNA深度測序技術（RNA deep sequencing）發現過表達28s rRNA rtsRNA可以抑制GDF15以及多個核糖體蛋白（ribosomal protein）mRNA的表達。通過本項目的開展，我們發現了一類新的rRNA來源的小RNA，它們具有末端來源的特殊分布模式，不依賴於miRNA加工生成途徑，受過氧應激誘導，過表達後可抑制GDF15以及多個核糖體蛋白mRNA的表達。本研究的完成，深化了我們對“rRNA 降解過程具有主動生物學調控意義”的認識，同時擴展了我們對小RNA 來源及調控功能的認識。
