16拼字母在聲韻調的位置上作聲韻調，音節由2-3個字母組成，其中用3個字母作聲韻調的音節稱3碼音節，只用兩個字母充當聲韻調（其中一個字母兼作韻母和調母）的音節稱簡碼音節。韻母為“ a i u ”的漢字特別多（約占總字數的四分一）。16拼作純拼音時，韻母為“a i u ”的標調音節都用兩個字母組成可以帶調拼讀的簡碼音節，即在漢語中有近四分一的漢字可以用兩個字母作全拼來拼寫。16拼的音節中的第二個字母都是自然結束字母。自然結束字母在音節中不能少，少了不成音節，也不能多，多出來的是下一音節的字母。由於每個簡碼音節的第二個字母和3碼的第三個字母都是自然結束字母，所以每個16拼的輸入結束碼就自然成為自然結束碼，這是16拼跟其它拼音字不同的地方。如漢語拼音音節 ji jia jian jiang jiangu jiangua ……從第一個音節起，每在後面增加一個字母都會改變音節的讀音。而在16拼中，絕不允許出現這種現象，16拼音節的長度和讀音是絕對穩定的。
由於聲母g k h與j q x所拼的韻母不同，在3碼16拼中可以用同一組字母表示，再用韻母來區分聲母g k h和j q x。又可以將聲母z c s g k h改用擴展字母01、02、03、51、52、53（即拉丁字母z c s g k h）表示。16拼聲母用“v”表示零聲母。凡韻母自成音節的都要在韻母前面添加零聲母。16拼中的聲母各用一個字母表示，都能用一碼無重碼地輸入電腦。
用筆畫字母組合16拼時，拼式聲韻中的四個筆畫可以按順序巧妙地組合成和形聲字形旁一樣的素音字聲旁，然後再設定三類調號部件添加在素音字聲旁右邊與聲旁組成能用聲韻調拼讀的素音字。方塊16拼的三類輕聲調號可以借用字母“ I i l ”添加在方塊拼式的右邊作輕聲調符，用w鍵、y鍵 空格鍵輸入電腦。方塊素音字的字例如下面圖片中的方塊16拼。
素音字適宜用來音譯外來語。如網上常用的追星族“冬粉”容易與食用“冬粉”混淆，改用素音字音譯外來語“冬粉”（見上圖中的F），兩種“冬粉”就不再混淆。此外，一些不會產生歧義的漢語詞句同樣可以用素音字來寫。如“緊跟潮流勇敢攀登”可以寫成上圖A中的素音字。圖中B素音字的聲旁筆畫是2142 2123 1233，E素音字的聲旁是將筆畫4434 2443 2122 3222 4142按筆畫組字規則變寫而成的聲旁，掌握筆畫組字規則就能拼讀。素音字的筆畫數碼字母作聲母時，筆畫素碼字母21 12 44 24 32 41作聲母 j(g) ch l v p d；筆畫數碼字母42 23 33 34 43 22作韻母eng en ao ou ong an。上圖素音字的右邊都是筆畫調母。C素音字調號底橫上的短豎是連線到調號上的分詞符。帶分詞符的素音字稱詞末字，詞末字寫在詞末，在連寫中有自然分詞的作用。不帶分詞符的素音字（如上圖E中的素音字）稱詞前字。上圖A中的最後一個素音字寫在句末，可以不加分詞符。上圖D的調母是純一聲調母的兩種寫法。
