黃佳良，男，博士，廈門大學生命科學學院教授，博士生導師。
基本介紹
- 中文名：黃佳良
- 畢業院校：中國科學院遺傳與發育生物學研究所
- 學位/學歷：博士
- 職業：教師
- 任職院校：廈門大學生命科學學院
個人經歷,研究方向,學術成果,
個人經歷
2005年，福州大學，生物工程學士
2008年，福州大學，計算機軟體與理論碩士
2012年，中國科學院遺傳與發育生物學研究所，生物信息學博士
2011-2013，葛蘭素史克上海醫藥研發有限公司，科學家
2013-2018，哈佛大學Dana-Farber癌症研究所/波士頓兒童醫院，博士後
2018年至今，廈門大學生命科學學院，閩江學者特聘教授
生物信息學與表觀基因組學（Bioinformatics and Epigenomics）課題組長
研究方向
利用生物信息學（乾）和分子生物學（濕）等方法，研究哺乳動物發育和癌症的表觀遺傳調控機制。圍繞某一特定生物學問題，基於現有/產生表觀基因組學等圖譜，利用生物信息學方法在系統層面提出具體的生物學假設，並採用CRISPR/cas9基因編輯等手段開展實驗驗證。具體研究方向包括（1）設計生物信息學算法，解決生物組學數據分析的定量問題；（2）整合已有表觀基因組學數據，構建發育過程中的增強子動態調控網路，尋找關鍵調控因子；（3）與臨床醫生/生物學家合作，利用單細胞組學等技術，探索癌症發生和治療的細胞異質性，尋找潛在藥物靶標。
學術成果
1.J. Huang#, K. Li#, W. Cai, X. Liu, Y. Zhang, S. H. Orkin, J. Xu*, G.-C. Yuan*. Dissecting super-enhancer hierarchy based on chromatin interactions. Nature Communications, 2018; 9:943.
2.J. Huang#, X. Liu#, D. Li#, Z. Shao#, H. Cao, Y. Zhang, E. Trompouki, T. V. Bowman, L. I. Zon, G.-C. Yuan, S. H. Orkin*, J. Xu*. Dynamic control of enhancer repertoires drives lineage and stage-specific transcription during hematopoiesis. Developmental Cell, 2016; 36, 9-23.
3.J. Huang, E. Marco, L. Pinello, G.-C. Yuan*. Predicting chromatin organization using histone marks. Genome Biology, 2015; 16, 162.
4.J. Huang, C. Niu, C. D.Green, L. Yang, H. Mei*, J.-D. J. Han*. Systematic prediction of pharmacodynamic drug-drug interactions through protein-protein-interaction network. PLoS Computational Biology, 2013; 9, e1002998.
5.J. Huang, Y. Liu, W. Zhang, H. Yu and J.-D. J. Han*. eResponseNet: a package prioritizing candidate disease genes through cellular pathways. Bioinformatics, 2011; 27, 2319-2320.
6.E. Marco#, W. Meuleman#, J. Huang#, K. Glass, L. Pinello, J. Wang, M. Kellis*, G.-C. Yuan*. Multi-scale chromatin state annotation using a hierarchical hidden Markov model. Nature Communications, 2017; 8, 15011.
7.S. Beyaz#, J. Kim#, L. Pinello#, Y. Hu, M. A. Kerenyi, P. P. Das, R. A. Barnitz, M. E. Xifaras, R. Dogum, J. Huang, W. N. Haining, O. Yilmaz, G.-C. Yuan, S. H. Orkin*, F. Winau*. The histone demethylase UTX regulates the lineage-specific epigenetic program of invariant natural killer T cells. Nature Immunology. 2017; 18, 184-195.
8.H. Xie, C. Peng, J. Huang, B. Li, W. Kim, E. Smith, Y. Fujiwara, J. Qi, G. Cheloni, P. P. Das, M. Nguyen, S. Li, J. E. Bradner, S. H. Orkin*. Chronic myelogenous leukemia initiating cells require Polycomb group protein EZH2. Cancer Discovery, 2016; 6, 1237-1247.
9.S. Luc, J. Huang, J. McEldoon, E. Somuncular, D. Li, C. Rhodes, S. Mamoor, S. Hou, J. Xu, S. H. Orkin*. Bcl11a-deficiency causes hematopoietic stem cell defects with an aging-like phenotype. Cell Reports, 2016; 16, 3181-3194.
10.J. Xu#, Z. Shao#, D. Li, H. Xie, W. Kim, J. Huang, J. E. Taylor, L. Pinello, K. Glass, J. D. Jaffe, G.-C. Yuan, S. H. Orkin*. Developmental control of polycomb subunit composition by GATA factors mediates a switch to non-canonical functions. Molecular Cell, 2015; 57, 304-316.
