類別驅動的RNA二級結構預測方法研究

《類別驅動的RNA二級結構預測方法研究》是依託哈爾濱工業大學,由張岩擔任項目負責人的面上項目。

基本介紹

  • 中文名:類別驅動的RNA二級結構預測方法研究
  • 依託單位:哈爾濱工業大學
  • 項目類別:面上項目
  • 項目負責人:張岩
  • 批准號:60671011
  • 申請代碼:F0124
  • 負責人職稱:副教授
  • 研究期限:2007-01-01 至 2009-12-31
  • 支持經費:26(萬元)
項目摘要
生物學研究已經證實某些RNA二級結構具有規律性典型結構,而目前的RNA二級結構預測方法將所有RNA統一處理。為此,本項目將RNA中具有典型二級結構和其它無明顯特徵的二級結構相區別,提出基於類別驅動的RNA二級結構預測方法。該方法優先預測某些RNA的典型二級結構,然後預測其剩餘部分或其它類別RNA的二級結構。為了模擬RNA分子的實際摺疊過程,降低算法複雜度,分別提出基於集合和置換個體表示的兩種遺傳算法的預測方法,並研究與生物學背景知識相一致的遺傳操作運算元。在此基礎上,設計合理的類別驅動RNA二級結構預測軟體系統,以避免目前其它方法的預測結果缺乏領域知識指導的缺點。因而,本項目研究在信息科學與生命科學相結合方面具有特色,有一定的理論價值和較大的套用前景。

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