《雲南省C型肝炎病毒遺傳多樣性及其進化差異研究》是依託昆明理工大學，由夏雪山擔任項目負責人的地區科學基金項目。
基本介紹
- 中文名：雲南省C型肝炎病毒遺傳多樣性及其進化差異研究
- 項目類別：地區科學基金項目
- 項目負責人：夏雪山
- 依託單位：昆明理工大學
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
高度的核酸變異性和由此造成的遺傳多樣性是C型肝炎病毒的主要特點，也是藥物療效差和疫苗研製困難的根本原因。不同類型HCV傳播行為與進化的差異，則導致HCV基因型/亞型具有明顯的地區、人群、時間分布特性。本項目擬在前期研究已闡明雲南省HCV多基因型/亞型分布特點的基礎上，採集現時段樣本，進行HCV基因序列測定與分析，確定雲南省主要流行基因型及其變異特點，發現新的基因型/亞型/重組型，闡明HCV的遺傳多樣性；通過同源性比較和進化分析，明確主要流行基因型的進化特點，推測其傳入時間、來源地點，併科學預測雲南省HCV基因型分布的變化趨勢及其對全國HCV傳播與流行的影響。本研究把常規HCV病毒核酸序列測定分析技術與朔祖理論及進化分子鐘分析方法相結合，將從現時HCV遺傳多樣性、歷史傳播行為和將來流行趨勢等不同層面，為雲南省乃至全國C型肝炎的預防控制策略的制定提供研究依據。
結題摘要
在本課題的支持下，研究組通過廣泛合作，分別從大理（527）和昆明（150）靜脈吸毒人群中得到HCV感染者血漿樣品總計677份，以HCV 5’NCR 和NS5b 區作為主要分型區段，確定了該人群的HCV基因型和亞型的分布。發現該人群呈現出以HCV3b為主1b、3a為輔，6型複雜多樣的流行態勢。利用NS5b區段為目的序列，進行HCV主要流行基因型3b、1b、3a和6n型內差異度，和進化分析（進化速率、起源時間、起源地），發現不同基因型的起源時間、起源地以及感染人群的爆發時間各不相同。 確定了雲南省瀘西縣及昆明市的720名普通人群中近超過30%的HCV高感染率。經肝功生化指標與病毒載量等病毒學指標比較發現，肝損傷與AST、ALT和AKP等生化指標的升高直接相關，但與HCV病毒載量不相關。在雲南省普通人群中HCV感染者中，HCV基因型分布主要包括1b、2a、3a、3b和6n五種基因亞型。該HCV基因型亞型的分布與雲南地區靜脈吸毒人群的相比有明顯差異，但HCV 3b和1b基因型為主的流行趨勢一致。 選擇了不同基因型的HCV單感染患者，在其自然病程中連續採集血樣，擴增高變的E2和NS5A區基因區段，多克隆測序並進行準種多樣性分析。發現慢性感染者NS5A區準種核苷酸變化主要是由遺傳漂變引起的，體內NS5A區變異模式相同，即E2區和NS5A區兩個基因區段存在協同進化關係。 對雲南省不同人群和不同地區中GBV-C的感染、基因型流行、進化起源以及高清除率的相關機制的研究發現，GBV-C在雲南地區高度流行且發現了新的基因型並命名為GBV-C 7型，提出了以E2區序列為基礎的基因型分型的新標準；通過對GBV-C進化和起源的研究，闡明了我國和雲南地區的GBV-C基因型進化特點和傳播路徑。 對臨床採集的75例HBV感染者血漿樣本，進行核酸提取，S區段基因擴增，核酸序列測定與分析，發現雲南地區HBV基因型的分布總體與中國大部分地域B、C為主要流行的趨勢一致，但仍存在東南亞最新流行的C1、C5與I型，及在中國西北新疆、西藏、寧夏等地曾發現的C/D重組型。此HBV流行與傳播態勢，可能因販毒、吸毒，受到東南亞地區主要HBV基因型的影響，並進一步影響中國HBV基因型分布態勢。 以上結果初步闡明了HCV、GBV-C及HBV雲南省傳播、流行與進化情況，為血緣傳播病毒性肝炎病原體的預防控制提供了科學依據。
