陳興(中國礦業大學生物信息研究所所長)

陳興，32歲，中國礦業大學信息與控制工程學院教授,博導,中國礦業大學生物信息研究所所長,中國礦業大學首批越崎學者，江蘇省六大人才高峰高層次人才，中國工業與套用數學學會數學生命科學專業委員會秘書長，遼寧省生物大分子計算模擬與信息處理工程技術研究中心專家委員會副主任，江蘇省生物信息學專業委員會和人工智慧學會智慧型系統與套用專業委員會委員。SCI論文89篇，EI檢索3篇，影響因子累計約388，其中第一作者49篇, 通訊作者73篇。以一作或者通訊發表中科院一區論文25篇，以一作或者通訊發表中科院二區以上論文54篇，以一作或者通訊發表JCR一區論文55篇。發表論文被Nature Reviews Genetics、Nature Chemistry、Nature Reviews Endocrinology等國際著名雜誌引用總計2657次，目前8篇論文為ESI高被引論文，1篇論文為ESI熱點論文，其中被影響因子5以上雜誌他引400餘次，H-因子為27，17篇論文引用次數超過50，7篇論文引用次數超過100，單篇最高引用次數為416。

基本介紹

• 中文名：陳興
• 外文名：Xing Chen
• 國籍：中國
• 民族：漢族
• 出生地：安徽省巢湖市
• 出生日期：1984年
• 職業：教授
• 畢業院校：中國科學院
• 主要成就：SCI論文91篇，影響因子累計約400，其中一作47篇, 通訊71篇 
  中國礦業大學教授、博導、中國礦業大學生物信息研究所所長 
  發表論文被國際著名雜誌引用總計2657次，H-因子為27 
  教育部高等學校優秀成果獎二等獎、中國礦業大學首批越崎學者等 
  三家中科院二區雜誌副主編 
  三家SCI雜誌編委 
  江蘇省第十四批“六大人才高峰”高層次人才（2017） 
  中國工業與套用數學學會數學生命科學專業委員會秘書長 
  七家SCI雜誌首席特約編委 
  8篇論文為ESI高被引論文，1篇論文為ESI熱點論文 
  江蘇省教育教學與研究成果獎高校自然科學研究類一等獎 

工作經歷

2016.5-今 中國礦業大學信息與控制工程學院，教授、博導、中國礦業大學首批越崎學者、中國礦業大學生物信息研究所所長

2012.7-2016.5 中國科學院國家數學與交叉科學中心生物醫學部 助理研究員

2012.7- 2016.5 中國科學院數學與系統科學研究院 助理研究員

主要成就

陳興，33歲，現任中國礦業大學信息與控制工程學院教授,博士生導師,中國礦業大學生物信息研究所所長,中國礦業大學首批越崎學者，江蘇省第十四批“六大人才高峰”高層次人才，中國工業與套用數學學會數學生命科學專業委員會秘書長，遼寧省生物大分子計算模擬與信息處理工程技術研究中心專家委員會副主任，江蘇省生物信息學專業委員會委員，江蘇省人工智慧學會智慧型系統與套用專業委員會委員。擔任JCR一區雜誌Frontiers in Genetics(影響因子4.151)、JCR一區雜誌Frontiers in Plant Science(影響因子3.678)、中科院二區雜誌BMC Systems Biology(影響因子2.605)三家SCI雜誌副主編，擔任Scientific Reports（影響因子4.122）、Current Protein & Peptide Science (影響因子2.696）、Current Proteomics (影響因子0.606）三家SCI雜誌編委，擔任JCR一區雜誌Frontiers in Microbiology（影響因子4.019）、中科院二區雜誌Current Medicinal Chemistry（影響因子3.469）、International Journal of Molecular Sciences（影響因子3.687）、Current Topics in Medicinal Chemistry（影響因子3.374）等七家SCI雜誌首席特約編委。陳興從事生物信息學和系統生物學領域的相關研究，主要研究工作集中在開發和利用複雜網路、機器學習、深度學習、圖論、組合數學等方法對於複雜疾病、非編碼RNA和網路藥理學方面的系統生物學領域的多個重要問題進行探索和研究，並取得一系列重要進展。研究方向包括致病基因識別、microRNA與疾病關係預測、疾病相關的非編碼RNA-環境因子組合作用預測、lncRNA與疾病關係研究、非編碼RNA大規模功能類似性網路構建、疾病-微生物關聯預測研究、藥物靶點預測、藥物組合研究、蛋白質相互作用預測等。這些研究方向是近年來數學、計算機科學和生命科學等諸多領域交叉研究的前沿和熱點，具有很重要的理論意義和實際指導意義。至今在Bioinformatics (影響因子5.481，4篇，數學與計算生物學中科院一區，均為第一作者兼通訊作者)、PLoS Computational Biology(影響因子3.955, 4篇，數學與計算生物學中科院一區，3篇第一作者，3篇通訊作者)、Nucleic Acids Research (影響因子11.561, 2篇，生物大類中科院一區，生化與分子生物學中科院一區，1篇通訊作者) 、Briefings in Bioinformatics (影響因子6.302，4篇，生物大類中科院一區，數學與計算生物學中科院一區，生化研究方法中科院一區，均為第一作者兼通訊作者)等國際期刊發表論文93篇（SCI論文88篇，EI檢索3篇，影響因子累計約384），其中第一作者48篇, 通訊作者72篇。以一作或者通訊發表中科院一區論文25篇，以一作或者通訊發表中科院二區以上論文53篇，以一作或者通訊發表JCR一區論文54篇。發表論文被Nature Reviews Genetics、Nature Chemistry、Nature Reviews Endocrinology等國際著名雜誌引用總計2657次，目前8篇論文為ESI高被引論文，1篇論文為ESI熱點論文，其中被影響因子5以上雜誌他引400餘次，H-因子為27，17篇論文引用次數超過50，7篇論文引用次數超過100，單篇最高引用次數為416，曾獲教育部高等學校科學研究優秀成果獎自然科學獎二等獎、江蘇省教育教學與研究成果獎高校自然科學研究類一等獎、中國礦業大學越崎學者、江蘇省第十四批“六大人才高峰”高層次人才、國際網路博弈論大會最佳論文獎、第七屆圖論與組合算法國際研討會"青年論文獎" 二等獎、第四屆世界華人數學家大會新世界數學獎、中科院數學院院長獎學金、博時獎學金、永安期貨獎學金、英達獎學金、美國數學建模競賽國際一等獎等榮譽，主持或以骨幹身份參與國家自然科學基金重點基金、國家自然科學基金重大研究計畫、國家自然科學基金面上項目、國家自然科學基金青年基金、國家自然科學基金專項基金項目數學天元基金、江蘇省第十四批“六大人才高峰”高層次人才項目、中國科學院國家數學與交叉科學中心數學與生物醫學交叉研究部重大專項、中國礦業大學越崎學者人才引進項目、中國礦業大學學科前沿科學研究專項面上項目、廣東省移動網際網路套用中間件工程技術研究中心開放課題、深圳大學大數據系統計算技術國家工程實驗室開放課題等17項重要項目。擔任八家國際生物信息學會議的程式委員會成員，擔任北京青少年科技俱樂部活動委員會學術指導導師和《2012－2013運籌學學科發展報告》編寫組成員。

項目經歷

2018.4-2020.3主持深圳大學大數據系統計算技術國家工程實驗室開放課題《基於智慧型算法的lncRNA功能預測研究》

2018.01-2018.12主持國家自然科學基金面上項目《多視角識別長非編碼RNA和人類複雜疾病關聯預測研究》

2017.12-2018.11主持廣東省移動網際網路套用中間件工程技術研究中心開發課題《疾病相關miRNA預測研究》

2017.07-2020.6主持江蘇省第十四批“六大人才高峰”高層次人才項目《長非編碼RNA生物大數據處理和預測》

2017.01-2019.12主持中國礦業大學學科前沿科學研究專項面上項目《基於計算智慧型算法的藥物靶點預測研究》

2017.01-2021.12參與國家自然科學基金重點基金《圖理論和算法研究及其在生物信息學中的套用》

2016.06-2021.05主持中國礦業大學越崎學者人才引進項目《基於非編碼RNA的生物大數據研究及生物信息研究所平台建設》

2015.01-2015.12參與北京理工大學智慧型控制與複雜系統國家重點實驗室基金《基於問題結構的自學習群智慧型最佳化生產調度理論與方法》

2014.01-2016.12主持國家自然科學基金青年基金《多視角識別人類複雜疾病相關microRNA的數學模型與方法研究》

2013.10-2014.09參加國家自然科學基金專項基金項目數學天元基金《協同藥物研發中的關鍵數學問題》
2013.1-2015.12參與國家自然科學基金重大研究計畫培育項目《非可控性炎症調控網路體內定量監視預測技術研究》

2012.7-至今參加中國科學院國家數學與交叉科學中心數學與生物醫學交叉研究部重大專項《重大慢性多發疾病的動態網路系統構建》

2012.1-2013.06參與首都安全技術支撐平台（一期）《安全生產數據挖掘與模型構建》項目
2010.12-2012.06主持中國科學院研究生科技創新與社會實踐資助專項科技創新類項目《藥物靶點作用預測》
2009.12-2010.12主持中國科學院研究生科技創新與社會實踐資助專項社會實踐類項目《北京和威海青年創業現狀分析及調研》
2009.06-2010.12參與北京市科技計畫項目《城市公共設施事故應急的多部門協同決策模型研究》
2009.06-2010.12參與北京市科委課題《首都安全生產風險評估與預測預警技術研究》的子課題《安全生產數據挖掘與模型構建研究》
2008.01-2012.12參與中科院知識創新工程重要方向項目《生物分子網路中的模型與算法》

獲獎情況

江蘇省教育教學與研究成果獎高校自然科學研究類一等獎，2018

江蘇省第十四批“六大人才高峰”高層次人才，2017

第七屆圖論與組合算法國際研討會"青年論文獎" 二等獎，中國運籌學會圖論組合分會，2017

教育部高等學校科學研究優秀成果獎自然科學獎二等獎《複雜生物數據的特徵建模及高效學習理論與套用》，高等學校科學研究優秀成果獎(科學技術)獎勵委員會，2016

越崎學者，中國礦業大學，2016

Best Paper Award of the 2014 5th International Conference on Game Theory for Networks, Executive Committee and Award Committee of GameNets 2014, 2014.
中國科學院博時獎學金特等獎，中國科學院數學與系統科學研究院，2012
中國科學院永安期貨獎學金優秀獎，中國科學院數學與系統科學研究院，2011
中科院研究生院數學科學學院2011年博士(後)學術論壇最佳報告獎，中國科學院研究生院數學科學學院，2011
中國科學院數學與系統科學研究院院長獎學金優秀獎，中國科學院數學與系統科學研究院，2010
中國科學院英達獎學金優秀獎，中國科學院數學與系統科學研究院，2010
2009中科張江杯青年技術創新大賽三等獎，中國科學院計算技術研究所與上海張江集團（有限）公司，2009
第四屆世界華人數學家大會新世界數學獎優異獎（第一次評選），世界華人數學家大會組委會，2007
美國數學建模競賽國際一等獎（隊伍隊長），美國大學生數學建模組委會，2006
全國數學建模競賽國家二等獎（隊伍隊長），教育部高等教育司與中國工業與套用數學學會，2005
全國大學生英語競賽國家二等獎，高等學校大學外語教學指導委員會與高等學校大學外語教學研究會，2005

學術活動

在Bioinformatics (影響因子5.481，4篇，數學與計算生物學中科院一區，均為第一作者兼通訊作者)、PLoS Computational Biology(影響因子3.955, 4篇，數學與計算生物學中科院一區，3篇第一作者，3篇通訊作者)、Nucleic Acids Research (影響因子11.561, 2篇，生物大類中科院一區，生化與分子生物學中科院一區，1篇通訊作者) 、Briefings in Bioinformatics (影響因子6.302，4篇，生物大類中科院一區，數學與計算生物學中科院一區，生化研究方法中科院一區，均為第一作者兼通訊作者)等國際期刊發表論文93篇（SCI論文88篇，EI檢索3篇，影響因子累計約384），其中第一作者48篇, 通訊作者72篇。以一作或者通訊發表中科院一區論文25篇，以一作或者通訊發表中科院二區以上論文53篇，以一作或者通訊發表JCR一區論文54篇。發表論文被Nature Reviews Genetics、Nature Chemistry、Nature Reviews Endocrinology等國際著名雜誌引用總計2657次，目前8篇論文為ESI高被引論文，1篇論文為ESI熱點論文，其中被影響因子5以上雜誌他引400餘次，H-因子為27，17篇論文引用次數超過50，7篇論文引用次數超過100，單篇最高引用次數為416，引起國內外相關研究人員的廣泛興趣. 尤其是四篇關於長非編碼RNA、微生物和miRNA的論文發表在Bioinformatics (影響因子 7.307，中科院一區，均為第一作者兼通訊作者)雜誌上，其中第一篇文章構建業內公認第一個大規模lncRNA與疾病關係預測模型，引用117次，第二篇文章是第一個預測微生物與疾病關聯的預測工具，為ESI高被引論文；長鏈非編碼RNA（lncRNA）相關綜述、藥物靶點綜述、miRNA相關綜述、RNA甲基化相關綜述均發表在Briefings in Bioinformatics雜誌 (影響因子5.134，數學與計算生物學中科院一區，均為第一作者和通訊作者),前兩篇文章分別引用96和104次，均為ESI高被引論文，第一篇論文是ESI熱點論文；一篇關於增效藥物組合的工作原創性的給出了增效藥物組合預測方法，通過預測方法得到的抗真菌藥物組合13組中有7組得到生物實驗驗證，該方法申請專利目前已經獲得國家發明專利授權，論文發表在國際計算生物學頂級期刊PLoS Computational Biology (影響因子 4.542，數學與計算生物學中科院一區，第一作者)雜誌上，論文被引用51次；另有三篇關於miRNA與疾病關聯預測的工作也發表在PLoS Computational Biology雜誌上，其中一篇為ESI高被引論文；申請人是為數不多可以以通訊作者或者第一作者身份在Bioinformatics、PLoS Computational Biology和Briefings in Bioinformatics三大生物信息學/計算生物學頂級期刊上同時發表論文的中國大陸學者（從2013年到2018年內在這三大雜誌發表論文12篇，11篇第一作者，11篇通訊作者）；另外發表在Molecular BioSystems雜誌的藥物靶點作用預測文章被該雜誌評選為Top ten most accessed articles in June和Top 10% of the most highly cited articles published in the latest Impact Factor window (2011-2012)，目前被引用208次；發表在Nucleic Acids Research的lncRNA與疾病關聯資料庫文章目前被引用416次，入選ESI高被引論文；論文被評選為國際網路博弈論大會最佳論文獎和第七屆圖論與組合算法國際研討會青年論文獎。

專利：一種藥物增效組合預測方法及實驗驗證. 201110210508.0 閆桂英 張立新 陳興 任彪 陳明 王令新 劉明熹 正式授權

副主編: Frontiers in Genetics (SCI, 影響因子4.151，2018-至今); Frontiers in Plant Science (SCI, 影響因子3.678，2018-至今); BMC Systems Biology (SCI, 影響因子2.050，2017-至今）

編委：Scientific Reports (影響因子4.122，2017-至今）; Current Protein & Peptide Science (SCI, 影響因子2.696，2017-至今）; Current Proteomics (SCI, 影響因子0.606，2018-至今）

首席特約編委： Current Protein & Peptide Science (SCI, 影響因子2.696, Special issue on Identifying drug–target interactions based on heterogeneous biological data (https://benthamscience.com/journals/current-protein-and-peptide-science/volume/19/issue/5/，2014-2018); BioMed Research International (SCI, 影響因子2.583, Special issue on Current Computational Models for Prediction of the Varied Interactions Related to Non-Coding RNAs, http://www.hindawi.com/journals/bmri/si/709461/, 2016); Frontiers in Microbiology (SCI, 影響因子4.019, Special issue on Bioinformatics in Microbiota，2017-至今); Current Medicinal Chemistry (SCI, 影響因子3.469, Special issue on Computational Methods for drug discovery，2017-至今); International Journal of Molecular Sciences (SCI, 影響因子3.687, Special issue on Computational Models in Non-Coding RNA and Human Disease，2018-至今); Current Topics in Medicinal Chemistry (SCI, 影響因子3.374, Special issue on Application of Computational Techniques in Pharmacy and Medicine, 2017-2018); Protein & Peptide Letters (SCI, 影響因子1.039, Special issue on Current Computational Models for Prediction of the Varied Interactions Related to Protein，2017-至今).

程式委員會成員：The 6th IEEE International Conference on Systems Biology (ISB 2012), The 7th International Conference on Systems Biology (ISB 2013), The 8th International Conference on Systems Biology (ISB 2014), The 4th Translational Bioinformatics Conference (TBC 2014), The 10th International Conference on Systems Biology (ISB 2016), The 13th International Symposium on Bioinformatics Research and Applications (ISBRA 2017), The 11th International Conference on Computational Systems Biology (ISB 2017), The 14th International Symposium on Bioinformatics Research and Applications (ISBRA 2018).

審稿人：Nucleic Acids Research、Bioinformatics、PLoS Computational Biology、Briefings in Bioinformatics、European Journal of Human Genetics、Journal of Molecular Biology、RNA Biology、Oncotarget、BMC Genomics、Scientific Reports、IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics、Biomedicine & Pharmacotherapy、International Journal of Oncology、Molecular BioSystems、PLoS ONE、BMC Bioinformatics、BMC Systems Biology、International Journal of Molecular Sciences、Journal of Biomedical Informatics、IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics、Molecular Genetics and Genomics、Expert Opinion On Drug Metabolism and Toxicology、Computer Methods and Programs in Biomedicine、Molecular Therapy - Methods & Clinical Development、Artificial Intelligence in Medicine、International Journal of Molecular Medicine、Journal of Theoretical Biology、Current Gene Therapy、RSC Advances、BioMed Research International、Cell Proliferation、Oncology Letters、Oncology Reports、The Scientific World Journal、Neurocomputing、IET Systems Biology、Current Bioinformatics、Bulletin of Mathematical Biology 、Computational Biology and Chemistry、Molecular Medicine Reports、Theory in Biosciences、Complexity、Quantitative Biology、Current Proteomics、Genomics, Proteomics & Bioinformatics、Journal of Biological Systems、Computers in Biology and Medicine、Acta Mathematicae Applicatae Sinica、Biomedical Engineering、Chinese Journal of Biochemistry Molecular Biology、Machine Vision and Applications和國際會議The 6th IEEE International Conference on Systems Biology (ISB2012), The 7th International Conference on Systems Biology (ISB 2013), The 8th International Conference on Systems Biology (ISB 2014), The 4th Translational Bioinformatics Conference (TBC 2014), International Conference on Bioinformatics 2014 (InCoB2014), The 10th International Conference on Systems Biology (ISB 2016)，ISMB/ECCB 2017

擔任中國工業與套用數學學會數學生命科學專業委員會秘書長

擔任遼寧省生物大分子計算模擬與信息處理工程技術研究中心專家委員會副主任

擔任江蘇省生物信息學專業委員會委員

擔任江蘇省人工智慧學會智慧型系統與套用專業委員會委員

擔任北京青少年科技俱樂部活動委員會學術指導導師

擔任《2012－2013運籌學學科發展報告》編寫組成員

部分代表性著作成果

1. Novel human lncRNA–disease association inference based on lncRNA expression profiles. Bioinformatics. 2013 29(20): 2617-2624 (SCI,影響因子5.481,數學與計算生物學中科院一區, JCR 1區,被引用117次).第一作者和通訊作者
2. A Novel Approach based on KATZ measure to Predict Associations of Human Microbiota with Non-Infectious Diseases. Bioinformatics. 2017 33(5):733-739 (SCI,影響因子5.481,數學與計算生物學中科院一區, JCR 1區,被引用33次,入選ESI高被引論文).第一作者和通訊作者
3. BNPMDA: Bipartite Network Projection for MiRNA-Disease Association prediction. Bioinformatics. 2018 34(18): 3178-3186 (SCI,影響因子5.481,數學與計算生物學中科院一區, JCR 1區).第一作者和通訊作者
4. Predicting miRNA-disease association based on inductive matrix completion. Bioinformatics. 2018Advance Access(SCI,影響因子5.481,數學與計算生物學中科院一區, JCR 1區).第一作者和通訊作者
5. MDHGI: Matrix Decomposition and Heterogeneous Graph Inference for miRNA-disease association prediction. PLoS Computational Biology. 2018 14(8): e1006418 (SCI,影響因子 3.955,數學與計算生物學中科院一區, JCR 1區). 第一作者和通訊作者
6. LRSSLMDA: Laplacian Regularized Sparse Subspace Learning for MiRNA-Disease Association prediction. PLoS Computational Biology. 2017 13(12): e1005912(SCI,影響因子 3.955,數學與計算生物學中科院一區, JCR 1區，被引用13次). 第一作者和通訊作者
7. NLLSS: Predicting Synergistic Drug Combinations based on semi-supervised learning. PLoS Computational Biology. 201612(7): e1004975(SCI,影響因子 3.955,數學與計算生物學中科院一區, JCR 1區,被引用51次). 第一作者
   該工作得到國內外大量媒體的關注和報導，例如BioPortfolio.com、ChinaUnix、EurekAlert、Make Me Feed、Medical Xpress、ScienceDaily、Scienmag、高新網、光明網、馬可諮詢、中國化工儀器網、中國科學院官網、中國生物技術信息網、中科院國家數學與交叉科學中心官網、中科院數學院官網，他們紛紛以“Novel algorithm predicts drug combinations to treat drug resistant fungal infections”、“科學家提出增效藥物組合預測新方法”、“數學模型和算法預測增效藥物組合研究獲進展”等為題對我們的這一重要工作進行報導。
8. PBMDA: A novel and effective path-based computational model for miRNA-disease association prediction. PLoS Computational Biology. 2017 13(3): e1005455(SCI,影響因子 3.955,數學與計算生物學中科院一區, JCR 1區,被引用58次,入選ESI高被引論文). 通訊作者
9. MeT-DB V2.0: elucidating context-specific functions of N6-methyl-adenosine methyltranscriptome. Nucleic Acids Research. 2018 46(Database issue):D281-D287(SCI, 影響因子11.561, 生物大類中科院一區, 生化與分子生物學中科院一區, JCR 1區). 通訊作者
10. Long non-coding RNAs and complex diseases: from experimental results to computational models. Briefings in Bioinformatics. 2017 18(4):558-576 (SCI, 影響因子6.302, 生物大類中科院一區，數學與計算生物學中科院一區，生化研究方法中科院一區, JCR 1區，被引用96次, 入選ESI高被引論文和ESI熱點論文). 第一作者和通訊作者
11. Drug–target interaction prediction: databases, web servers and computational models. Briefings in Bioinformatics. 2016 17(4):696-712 (SCI, 影響因子6.302, 生物大類中科院一區，數學與計算生物學中科院一區，生化研究方法中科院一區,JCR 1區,被引用104次,入選ESI高被引論文).第一作者和通訊作者
12. MicroRNAs and complex diseases: from experimental results to computational models. Briefings in Bioinformatics. 2017 Advance Access(SCI,影響因子6.302,生物大類中科院一區，數學與計算生物學中科院一區，生化研究方法中科院一區,JCR 1區,被引用20次).第一作者和通訊作者
13. RNA methylation and diseases: experimental results, databases, web servers and computational models. Briefings in Bioinformatics.2017 Advance Access(SCI,影響因子6.302,生物大類中科院一區，數學與計算生物學中科院一區，生化研究方法中科院一區,JCR 1區).第一作者和通訊作者
14. EGBMMDA: Extreme Gradient Boosting Machine for MiRNA-Disease Association prediction.Cell Death & Disease. 2018 9:3(SCI,影響因子5.638,生物大類中科院二區, JCR 1區,被引用13次).第一作者和通訊作者
15. RKNNMDA: Ranking-based KNN for MiRNA-Disease Association prediction.RNA Biology. 2017 14(7): 952-962(SCI,影響因子5.216,生物大類中科院二區, JCR 1區,被引用27次).第一作者和通訊作者
16. ELLPMDA: Ensemble learning and link prediction for miRNA-disease association prediction. RNA Biology. 2018 15(6): 807-818 (SCI,影響因子5.216,生物大類中科院二區, JCR 1區).第一作者和通訊作者
17. Predicting microRNA disease associations using bipartite local models and hubness aware regression. RNA Biology.2018 Advance Access(SCI,影響因子5.216,生物大類中科院二區, JCR 1區).第一作者和通訊作者
18. Inferring potential small molecule-miRNA association based on triple layer heterogeneous network. Journal of Cheminformatics.2018 10: 30(SCI,影響因子3.893,計算機：信息系統中科院一區, JCR 1區).通訊作者
19. Drug-target interaction prediction by random walk on the heterogeneous network. Molecular BioSystems.2012 8(7): 1970-1978 (SCI, 影響因子 2.759,被引用208次, Top ten most accessed articles in June 2012, Featured in the top 10% of the most highly cited articles published in the latest Impact Factor window (2011-2012)).第一作者
20. RWRMDA: predicting novel human microRNA–disease associations. Molecular BioSystems.2012 8(10): 2792-2798 (SCI, 影響因子 2.759,被引用140次).第一作者
21. Semi-supervised learning for potential human microRNA-disease associations inference. Scientific Reports. 2014 4:5501 (SCI,影響因子4.122, JCR 1區,被引用133次) .第一作者和通訊作者
22. WBSMDA: Within and Between Score for MiRNA-Disease Association prediction. Scientific Reports. 2016 6:21106 (SCI,影響因子4.122, JCR 1區,被引用107次,入選ESI高被引論文) . 第一作者和通訊作者
23. MCMDA: Matrix Completion for MiRNA-Disease Association prediction. Oncotarget. 2017 8(13):21187-21199 (SCI,被引用37次,入選ESI高被引論文) .通訊作者
24. Sequence-based Prediction of Protein-Protein Interactions Using Weighted Sparse Representation Model Combined with Global Encoding. BMC Bioinformatics. 2016 17:184 (SCI, 影響因子 2.213,數學與計算生物學中科院二區, JCR 1區,被引用42次,入選ESI高被引論文) . 通訊作者