《長非編碼RNA對腫瘤抑制蛋白SAFB1的調控及機制研究》是依託四川大學，由宋旭擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名：長非編碼RNA對腫瘤抑制蛋白SAFB1的調控及機制研究
- 項目類別：面上項目
- 項目負責人：宋旭
- 依託單位：四川大學
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
長非編碼RNA（lncRNA）的異常表達與腫瘤的發生髮展密切相關；lncRNA對蛋白質活性或對蛋白質複合物的調節是近年來lncRNA研究的重大發現之一，也可能是lncRNA發揮其生物學功能的重要途徑。腫瘤抑制蛋白SAFB1在負責調控癌症，特別是乳腺癌相關應激狀態的分子網路中處於重要地位。當前普遍認為SAFB1調控網路完全由蛋白質編碼基因構成，但我們的研究表明以lncRNA為代表的表觀調控機制也參與了SAFB1功能的調節以及SAFB1調控網路的構建。基於前期研究基礎，我們在本項目中將從分析lncRNA與SAFB1蛋白相互作用發生及選擇的分子基礎入手，系統研究lncRNA對SAFB1蛋白功能的調控及相應的調控機制，闡明lncRNA-SAFB1蛋白相互作用在乳腺癌發生髮展中的意義，為從表觀遺傳學角度闡釋乳腺癌的本質奠定基礎，也為探討乳腺癌的診斷及治療提供新的思路。
結題摘要
SAFB1(scaffold attachment factor B1)作為已知的腫瘤抑制基因與乳腺癌關係密切，同時，SAFB1也是RNA結合蛋白。越來越多的證據表明lncRNA (long non-coding RNA)具有重要的調控作用，並廣泛參與細胞的各種生理進程，如增殖生長、凋亡、應激反應等。為了篩選與SAFB1相互作用的lncRNA，我們採用SELEX-Seq (Systematic Evolution of Ligands by Exponential Enrichment with deep sequencing)技術對MCF7、SKBR3、MDA-MB-231、T-47D四種乳腺癌細胞系的細胞核RNA進行篩選，並從其中篩選得到了高豐度的763條RNA序列以及4種SAFB1識別基序（motif）。實驗驗證了基序以及基序所在的二級結構參與RNA與SAFB1蛋白相互作用。 我們重點研究了篩選得到的lncRNA scaRNA9，scaRNA9能與SAFB1、ERα直接相互作用，並且過表達scaRNA9能加強SAFB1與ERα之間的相互作用，下調scaRNA9減弱SAFB1與ERα之間的相互作用。敲低scaRNA9能使ERα的靶基因OPG的表達水平上調，PUMA的表達水平下調。同時敲低scaRNA9能抑制MCF7細胞增殖以及克隆形成能力。 綜上所述，我們通過SELEX-Seq篩選得到了SAFB1識別的RNA的4種基序，並且證實了基序和由基序摺疊形成的二級結構是RNA與SAFB1相互作用的基礎，為RNA與蛋白相互作用的分子機制提供了理論依據。並且具有生物學功能的scaRNA9可能成為潛在的腫瘤治療靶點。
