《鏈黴菌基因組島的比較組學研究》是依託上海交通大學，由歐竑宇擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名：鏈黴菌基因組島的比較組學研究
- 項目類別：面上項目
- 項目負責人：歐竑宇
- 依託單位：上海交通大學
- 批准號：30871345
- 申請代碼：C0602
- 負責人職稱：教授
- 研究期限：2009-01-01 至 2011-12-31
- 支持經費：33（萬元）
項目摘要
鏈黴菌是研究微生物遺傳多樣性的良好模式材料。對已測序鏈黴菌的比較分析表明，其染色體不穩定，結構較其他細菌複雜，由較保守的核心區及高度可變的兩臂組成；更為重要的是，許多與抗生素合成和致病性等相關的基因簇以基因組島的形式插入到染色體上。通過水平轉移獲得的基因組島有助於維持宿主在特定生態環境中獲得優勢。本項目擬分析天藍色鏈黴菌的重要基因組島, 包括砷抗性基因組島及DNA硫修飾依賴型限制系統基因組島；結合生物信息學和分子實驗技術搜尋和確定變鉛青鏈黴菌核心區新基因組島；識別已測序的井岡黴素高產菌吸水鏈黴菌井岡變種5008的基因組島。探討基因組島對鏈黴菌基因組穩定性的影響，並為大規模挖掘鏈黴菌可移動基因組和研究其對遺傳多樣性和進化的影響提供堅實基礎。
