內容簡介
醫學信息學是當前熱門的研究課題。本書結合了大量的實例,全面、系統地講解了醫學信息學的理論知識及在醫學領域的套用。主要內容包括生物醫學信息學概論、醫學信息標準化、資料庫與信息系統、醫院信息系統、醫學影像信息系統、實驗室信息系統、護理信息系統、醫學信息學、區域衛生信息平台、電子病歷、常用生物醫學信號處理方法、臨床決策支持系統、遠程醫療、生物信息學、醫學信息學的未來等。 在講解過程中,本書力求理論與實例結合,深入淺出,循序漸進,使讀者全面了解醫學信息學技術,提高分析問題、解決問題的能力。 本書可作為各大院校相關專業本科生和研究生的學習用書,也可作為廣大科研人員、學者的參考用書。
圖書目錄
第1篇 醫學信息學基礎
第1章 生物醫學信息學概論 ......................................................................3
1.1 信息科技與生物醫學深度融合 ..............................................................................3
1.2 信息技術不斷創新 ..................................................................................................6
1.3 醫學信息學發展迅猛 ..............................................................................................8
1.3.1 醫院信息系統 .............................................................................................8
1.3.2 醫學圖像信息系統 .....................................................................................9
1.3.3 實驗室信息系統 .......................................................................................10
1.3.4 護理信息系統 ...........................................................................................10
1.3.5 社區衛生信息系統 ...................................................................................11
1.3.6 區域衛生信息平台 ...................................................................................11
1.3.7 電子病歷及多種醫療系統的整合 ...........................................................13
1.4 生物組學研究的快速發展 ....................................................................................14
1.5 生物信息學是解決複雜生物學問題的鑰匙 ........................................................15
1.6 展望 ........................................................................................................................16
本章小結 .........................................................................................................................21
思考題 .............................................................................................................................21
第2章 醫學數據獲取與處理 ....................................................................22
2.1 生物醫學感測器基礎 ............................................................................................22
2.1.1 生物醫學感測器的定義與作用 ...............................................................22
2.1.2 生物醫學感測器的分類 ...........................................................................24
2.1.3 生物醫學感測器的特殊性與安全性 .......................................................25
2.1.4 生物醫學感測器的標定與校準 ...............................................................27
2.1.5 新型生物醫學感測器及系統 ...................................................................27
2.2 生物醫學信號的數據採集 ....................................................................................31
2.2.1 生物醫學數據採集系統 ...........................................................................31
2.2.2 嵌入式數據採集系統 ...............................................................................33
2.2.3 生物醫學無線感測器網路 .......................................................................34
2.3 常用生物醫學信號處理方法 ................................................................................38
2.3.1 時域分析方法 ...........................................................................................39
2.3.2 頻域分析方法 ...........................................................................................40
2.3.3 時頻聯合分析方法 ...................................................................................44
2.3.4 非線性分析方法 .......................................................................................47
本章小結 .........................................................................................................................50
思考題 .............................................................................................................................50
第3章 醫學信息標準化 ...........................................................................51
3.1 標準與標準化 ........................................................................................................51
3.1.1 標準 ...........................................................................................................51
3.1.2 標準化 .......................................................................................................52
3.1.3 標準化發展歷程 .......................................................................................54
3.1.4 信息標準化 ...............................................................................................54
3.2 分類與編碼 ............................................................................................................56
3.2.1 基本概念 ...................................................................................................56
3.2.2 分類與編碼的基本原則 ...........................................................................56
3.2.3 分類與編碼的方法 ...................................................................................57
3.3 醫學信息標準 ........................................................................................................58
3.3.1 制定醫學信息標準的艱巨性 ...................................................................58
3.3.2 醫學信息標準的類型 ...............................................................................59
3.4 醫學信息學常用標準 ............................................................................................60
3.4.1 國際疾病分類 ...........................................................................................60
3.4.2 系統醫學術語集 .......................................................................................61
3.4.3 疾病診斷相關組 .......................................................................................64
3.4.4 一體化醫學語言系統 ...............................................................................65
3.4.5 國際社區醫療分類 ...................................................................................66
3.4.6 Read臨床分類..........................................................................................67
3.4.7 觀測指標標識符邏輯命名與編碼系統 ...................................................67
3.4.8 醫學主題詞表 ...........................................................................................67
3.5 醫學信息交換標準 ................................................................................................68
3.5.1 HL7 ...........................................................................................................68
3.5.2 DICOM .....................................................................................................71
本章小結 .........................................................................................................................71
思考題 .............................................................................................................................71
目 錄
VII
第4章 醫學資料庫與信息系統 ................................................................72
4.1 資料庫與醫學資料庫 ............................................................................................72
4.1.1 資料庫的基本概念 ...................................................................................72
4.1.2 醫學資料庫的發展 ...................................................................................76
4.1.3 資料庫管理系統 .......................................................................................79
4.2 信息系統 ................................................................................................................79
4.2.1 信息系統的基本概念 ...............................................................................79
4.2.2 信息系統的分析與設計 ...........................................................................85
4.2.3 醫學信息系統的建設 ...............................................................................92
本章小結 .........................................................................................................................95
思考題 .............................................................................................................................95
第2篇 醫療信息系統
第5章 醫院信息系統 ..............................................................................99
5.1 醫院信息系統概述 ................................................................................................99
5.1.1 醫院信息系統的定義 .............................................................................100
5.1.2 醫院信息系統的現狀 .............................................................................101
5.2 醫院信息系統的功能與內容 ..............................................................................102
5.2.1 醫院信息系統的功能 .............................................................................102
5.2.2 醫院信息系統的內容 .............................................................................106
5.3 醫院信息系統的建設 ..........................................................................................108
5.3.1 醫院信息系統的建設策略 .....................................................................109
5.3.2 醫院信息系統的建設步驟 .....................................................................120
5.4 醫院信息系統的運行維護 ..................................................................................125
5.4.1 醫院信息系統運行維護的目的 .............................................................125
5.4.2 醫院信息系統運行維護的組織 .............................................................126
5.4.3 醫院信息系統運行維護的內容 .............................................................127
本章小結 .......................................................................................................................132
思考題 ...........................................................................................................................133
第6章 護理信息系統 ............................................................................134
6.1 護理信息系統的發展歷程 ..................................................................................134
6.1.1 護理學 .....................................................................................................135
6.1.2 護理管理學 .............................................................................................136
6.1.3 護理信息學 .............................................................................................138
6.2 護理信息系統 ......................................................................................................139
6.2.1 護理信息系統的定義 .............................................................................140
6.2.2 護理信息的特點 .....................................................................................140
6.2.3 傳統護理信息的處理方式 .....................................................................141
6.3 移動護理信息系統 ..............................................................................................141
6.3.1 移動護理信息系統的組成 .....................................................................142
6.3.2 移動護士工作站對護理工作的作用 .....................................................144
6.3.3 國內外移動護理信息系統的套用 .........................................................145
6.3.4 移動護理信息系統存在的不足 .............................................................146
6.4 移動護理信息系統的設計 ..................................................................................147
6.4.1 架構設計 .................................................................................................148
6.4.2 系統硬體設計 .........................................................................................148
6.4.3 系統功能及操作過程 .............................................................................149
6.5 案例 ......................................................................................................................151
6.5.1 案例一 .....................................................................................................151
6.5.2 案例二 .....................................................................................................152
本章小結 .......................................................................................................................153
思考題 ...........................................................................................................................153
第7章 醫學圖像信息系統 .....................................................................154
7.1 醫學圖像信息系統概述 ......................................................................................154
7.1.1 數字圖像的基本概念 .............................................................................154
7.1.2 醫學圖像成像原理與設備 .....................................................................155
7.1.3 醫學圖像的作用 .....................................................................................160
7.1.4 醫學圖像信息系統的發展歷程 .............................................................161
7.2 醫學圖像的管理與顯示 ......................................................................................161
7.2.1 醫學圖像標準 .........................................................................................161
7.2.2 醫學圖像採集 .........................................................................................163
7.2.3 醫學圖像存儲 .........................................................................................163
7.2.4 醫學圖像傳輸 .........................................................................................167
7.2.5 醫學圖像顯示 .........................................................................................168
7.2.6 醫學圖像處理 .........................................................................................169
7.3 醫學圖像信息系統的套用 ..................................................................................172
7.3.1 醫學圖像存儲與傳輸系統 .....................................................................173
7.3.2 放射信息系統 .........................................................................................174
7.3.3 信息系統整合 .........................................................................................176
7.4 案例:瀋陽某醫院的PACS系統 .......................................................................176
本章小結 .......................................................................................................................177
思考題 ...........................................................................................................................177
第8章 實驗室信息系統 .........................................................................178
8.1 實驗室信息系統概述 ..........................................................................................178
8.1.1 定義 .........................................................................................................178
8.1.2 建立實驗室信息系統的目的 .................................................................179
8.2 實驗室信息系統的主要技術 ..............................................................................179
8.2.1 模式識別技術 .........................................................................................179
8.2.2 條碼技術套用 .........................................................................................180
8.2.3 自動控制技術 .........................................................................................181
8.3 實驗室信息系統的功能 ......................................................................................183
8.3.1 LIS的用戶許可權管理 ..............................................................................183
8.3.2 基礎數據維護 .........................................................................................183
8.3.3 標本管理 .................................................................................................184
8.3.4 檢驗管理 .................................................................................................184
8.3.5 質量管理 .................................................................................................186
8.3.6 綜合查詢統計 .........................................................................................186
8.3.7 實驗室管理 .............................................................................................187
8.4 實驗室信息系統質量管理體系 ..........................................................................188
8.4.1 LIS認證體系的重要組成部分 ..............................................................188
8.4.2 LIS促進質量管理體系建立 ..................................................................188
8.5 檢驗業務基本流程 ..............................................................................................189
8.5.1 門、急診檢驗流程 .................................................................................189
8.5.2 住院部檢驗流程 .....................................................................................190
本章小結 .......................................................................................................................191
思考題 ...........................................................................................................................191
第9章 社區衛生信息系統 .....................................................................193
9.1 社區衛生信息系統概述 ......................................................................................193
9.1.1 社區衛生信息系統的定義 .....................................................................194
9.1.2 社區衛生信息系統的目標 .....................................................................194
9.2 社區衛生信息系統模型 ......................................................................................195
9.2.1 社區衛生信息系統的結構模型 .............................................................195
9.2.2 社區衛生信息系統的數據模型 .............................................................195
9.2.3 系統總體組成 .........................................................................................196
9.3 社區衛生信息系統 ..............................................................................................196
9.3.1 社區醫療管理子系統 .............................................................................196
9.3.2 社區醫院行政管理子系統 .....................................................................197
9.3.3 社區衛生服務管理子系統 .....................................................................197
9.4 社區衛生信息系統的設計與實現 ......................................................................200
9.4.1 突發公共衛生事件應急指揮信息系統概述 .........................................200
9.4.2 總體業務/信息流程——指揮控制閉環系統 ......................................202
9.4.3 套用架構 .................................................................................................202
9.4.4 套用系統設計 .........................................................................................203
9.5 案例:北京市社區衛生信息系統 .......................................................................206
9.6 案例: 東軟集團股份有限公司助力完善常州市社區衛生
信息系統 ...................................................................................................208
本章小結 .......................................................................................................................209
思考題 ...........................................................................................................................210
第10章 區域衛生信息平台 ...................................................................211
10.1 區域衛生信息平台概述 .................................................................................211
10.1.1 背景與意義 .....................................................................................211
10.1.2 區域衛生平台相關概念 .................................................................213
10.2 區域衛生信息平台的整體架構 .....................................................................215
10.2.1 整體架構分布 .................................................................................215
10.2.2 功能與服務類型 .............................................................................216
10.3 區域衛生信息平台的設計與實現 .................................................................218
10.3.1 設計理念 .........................................................................................218
10.3.2 實現方案 .........................................................................................219
10.4 區域衛生信息平台的具體實例 .....................................................................221
10.4.1 基於健康檔案的區域衛生信息化共享平台 .................................221
10.4.2 基於社區衛生服務的區域衛生信息交換平台 .............................222
10.4.3 大數據智慧型化區域衛生服務平台 .................................................225
本章小結 ....................................................................................................................227
思考題 ........................................................................................................................227
第3篇 生物信息學基礎
第11章 生物分子結構分析 ...................................................................231
11.1 基因結構及序列比對分析 .............................................................................231
11.1.1 基因結構 ..........................................................................................231
11.1.2 序列比對分析 ..................................................................................232
11.2 蛋白質結構預測 .............................................................................................233
11.2.1 蛋白質結構 ......................................................................................233
11.2.2 蛋白質結構預測 ..............................................................................234
11.3 常用的資料庫、軟體和資源 .........................................................................235
11.3.1 核酸資料庫 ......................................................................................236
11.3.2 蛋白質資料庫 ..................................................................................238
11.3.3 生物信息學線上分析工具 ..............................................................241
11.3.4 基因組瀏覽器 ..................................................................................245
本章小結 ....................................................................................................................246
思考題 ........................................................................................................................246
第12章 基因表達與網路調控分析 ........................................................247
12.1 基因表達與非編碼RNA分析 .......................................................................247
12.2 表觀遺傳學及其分析 .....................................................................................248
12.2.1 表觀遺傳學 .....................................................................................248
12.2.2 表觀遺傳學分析 .............................................................................249
12.3 轉錄組學及其研究方法 .................................................................................250
12.4 生物分子網路與通路分析 .............................................................................252
12.5 藥物生物信息學 .............................................................................................253
12.6 代謝通路資料庫 .............................................................................................254
本章小結 ....................................................................................................................255
思考題 ........................................................................................................................256
第4篇 醫學信息學前沿
第13章 基於5G的遠程醫療 ................................................................259
13.1 遠程醫療系統的概念 .....................................................................................259
13.1.1 遠程醫療的定義 .............................................................................259
13.1.2 遠程醫療的內涵 .............................................................................261
13.1.3 遠程醫療的目的 .............................................................................262
13.1.4 遠程醫療的發展歷程 .....................................................................262
13.2 遠程醫療系統的組成與功能 .........................................................................263
13.2.1 遠程醫療系統的組成 .....................................................................263
13.2.2 遠程醫療信息系統的功能 .............................................................264
13.3 遠程醫療的組織管理 .....................................................................................270
13.3.1 遠程醫療機構管理 .........................................................................270
13.3.2 遠程醫療專家管理 .........................................................................270
13.3.3 遠程醫療會診流程管理 .................................................................270
13.3.4 遠程醫療的隱私保護 .....................................................................271
13.4 遠程醫療套用 .................................................................................................271
13.4.1 遠程醫學診斷 .................................................................................271
13.4.2 遠程醫學治療 .................................................................................272
13.4.3 遠程監護 .........................................................................................272
13.5 遠程醫療發展趨勢 .........................................................................................273
13.6 案例:遠程醫療助力抗擊新冠肺炎疫情 ......................................................273
本章小結 ....................................................................................................................274
思考題 ........................................................................................................................274
第14章 電子病歷智慧型分析 ...................................................................275
14.1 電子病歷概述 .................................................................................................275
14.1.1 病歷的概念 .....................................................................................275
14.1.2 電子病歷 .........................................................................................277
14.1.3 中醫電子病歷 .................................................................................280
14.2 電子病歷的功能與集成 .................................................................................282
14.2.1 電子病歷的功能 .............................................................................282
14.2.2 電子病歷的集成 .............................................................................283
14.3 電子病歷的設計與實現 .................................................................................284
14.3.1 錄入功能 .........................................................................................284
14.3.2 顯示功能 .........................................................................................286
14.3.3 存儲與查詢功能 .............................................................................287
14.3.4 安全管理功能 .................................................................................290
14.3.5 案例:某醫院電子病歷系統 ..........................................................293
14.4 自然語言處理 .................................................................................................294
14.4.1 自然語言處理的基本概念 .............................................................294
14.4.2 自然語言處理的研究內容 .............................................................295
14.4.3 自然語言處理的研究方法 .............................................................297
14.4.4 自然語言處理的核心技術 .............................................................297
14.5 基於自然語言處理的電子病歷智慧型分析 .....................................................301
14.5.1 基本概念 .........................................................................................302
14.5.2 案例分析 .........................................................................................303
本章小結 ....................................................................................................................310
思考題 ........................................................................................................................310
第15章 多組學與精準醫學 ...................................................................311
15.1 精準醫學概述 .................................................................................................311
15.1.1 精準醫學的基本概念 .....................................................................311
15.1.2 精準醫學的興起與發展 .................................................................312
15.2 基因組學與精準醫學 .....................................................................................313
15.2.1 基因組學簡介 .................................................................................313
15.2.2 基因組信息學在精準醫學中的套用 .............................................314
15.2.3 藥物基因組學在精準醫學中的套用 .............................................315
15.2.4 宏基因組學在精準醫學中的套用 .................................................316
15.3 轉錄組學及表觀遺傳組學與精準醫學 .........................................................317
15.3.1 轉錄組學在惡性腫瘤精準診療中的套用 .....................................317
15.3.2 轉錄組學與藥物研發和臨床用藥指導 .........................................318
15.3.3 DNA甲基化在精準醫學中的套用 ................................................319
15.3.4 三維基因組學在精準醫學中的套用 .............................................321
15.3.5 表觀遺傳藥物與疾病精準治療 .....................................................322
15.4 案例:融合多組學數據的疾病樣本分類 ......................................................324
本章小結 ....................................................................................................................325
思考題 ........................................................................................................................325
第16章 智慧型臨床決策 ..........................................................................326
16.1 臨床決策支持系統概述 .................................................................................326
16.1.1 專家系統與智慧型決策支持系統 .....................................................327
16.1.2 知識的表示與推理 .........................................................................329
16.1.3 臨床決策支持系統的意義與種類 .................................................333
16.2 臨床決策支持系統的系統結構與主要特徵 .................................................334
16.2.1 臨床決策支持系統的系統結構 .....................................................334
16.2.2 臨床決策支持系統的主要特徵 .....................................................335
16.3 臨床決策支持方法 .........................................................................................336
16.3.1 醫學實驗結果分類 .........................................................................336
16.3.2 基於貝葉斯定理的預測 .................................................................338
16.3.3 基於期望的預測 .............................................................................339
16.3.4 基於深度學習的預測 .....................................................................342
16.4 臨床決策支持系統的設計 .............................................................................347
16.4.1 患者數據的獲取與驗證 .................................................................347
16.4.2 醫學知識的建模 .............................................................................347
16.4.3 醫學知識的導出 .............................................................................347
16.4.4 醫學知識的表示和推理 .................................................................347
16.4.5 系統性能的驗證 .............................................................................347
16.5 案例:中國首例AI+5G心臟手術 .................................................................348
本章小結 ....................................................................................................................348
思考題 ........................................................................................................................348
第17章 醫療知識圖譜 ..........................................................................350
17.1 醫療知識圖譜概述 .........................................................................................350
17.1.1 醫療知識圖譜的定義 .....................................................................351
17.1.2 醫療知識圖譜的相關產品 .............................................................351
17.2 醫療知識圖譜的構建 .....................................................................................352
17.2.1 醫療知識圖譜數據採集 .................................................................352
17.2.2 醫療知識圖譜的本體庫構建 .........................................................354
17.2.3 醫療知識圖譜的命名實體識別 .....................................................355
17.2.4 醫療知識圖譜的實體關係抽取 .....................................................356
17.2.5 醫療知識圖譜的實體對齊 .............................................................357
17.3 醫療知識圖譜的存儲及補全 .........................................................................359
17.3.1 醫療知識圖譜的存儲 .....................................................................359
17.3.2 醫療知識圖譜的補全 .....................................................................361
17.4 醫療知識圖譜的套用 .....................................................................................363
17.4.1 醫療信息搜尋引擎 .........................................................................363
17.4.2 醫療決策支持系統 .........................................................................364
17.4.3 醫療問答系統 .................................................................................365
本章小結 ....................................................................................................................365
思考題 ........................................................................................................................366
第5篇 展 望
第18章 醫學信息學展望 .......................................................................369
18.1 醫學信息學的現狀及挑戰 .............................................................................369
18.1.1 醫學信息學的研究熱點 .................................................................370
18.1.2 醫學信息學面臨的挑戰 .................................................................373
18.2 醫學信息學研究的目標、機遇與未來 .........................................................378
18.2.1 醫學信息學研究的目標 .................................................................378
18.2.2 醫學信息學研究的機遇與未來 .....................................................379
本章小結 ....................................................................................................................379
思考題 ........................................................................................................................380
習題答案 ..................................................................................................381
第1章 生物醫學信息學概論 ................................................................................381
第2章 醫學數據獲取與處理 ................................................................................381
第3章 醫學信息標準化 ........................................................................................383
第4章 醫學資料庫與信息系統 ............................................................................385
第5章 醫院信息系統 ............................................................................................388
第6章 護理信息系統 ............................................................................................389
第7章 醫學圖像信息系統 ....................................................................................390
第8章 實驗室信息系統 ........................................................................................392
第9章 社區衛生信息系統 ....................................................................................394
第10章 區域衛生信息平台 ..................................................................................395
第11章 生物分子結構分析 ..................................................................................397
第12章 基因表達與網路調控分析 ......................................................................397
第13章 基於5G的遠程醫療 ...............................................................................398
第14章 電子病歷智慧型分析 ..................................................................................399
第15章 多組學與精準醫學 ..................................................................................404
第16章 智慧型臨床決策 ..........................................................................................405
第17章 醫療知識圖譜 ..........................................................................................407
第18章 醫學信息學展望 ......................................................................................409
參考文獻 ..................................................................................................411
中英文辭彙對照表 ....................................................................................415