“農業部淡水魚類種質監督檢驗測試中心”於 2000年10月首次通過農業部和國家質量技術監督局的“雙認證”驗收，2004年、2009年、2012年、2015年四次通過複查。農業部淡水魚類種質監督檢驗測試中心現授權承擔水產種質、漁業環境、水產品、漁用飼料和漁用藥物的檢驗以及農產品地理標誌產品品質鑑定等資質。獲得的審查認可證書號和資質認定證書號分別為：（2015）農（質監認）字FC第544號和150004091965，考核合格證書：[2015]農質檢核（國）字第0072號。
農業部淡水魚類種質監督檢驗測試中心現有工作人員18人，其中高、中級職稱人員15人，占83.3%，技術人員16人，占88.9%。所涉及的專業有水產藥物殘留檢測技術、魚類飼料與營養、水產遺傳育種與種質參數研究、漁業環境、漁用藥物代謝動力學與病害研究、標準化、微生物與計算機等方面。
農業部淡水魚類種質監督檢驗測試中心建築面積約3500m2，固定資產近2500萬元，配備有國內外較先進的檢測儀器設備150多台（套），其中包括高效液相色譜儀、超高壓液相色譜儀、液相-質譜聯用儀、氣相色譜儀、氣相-質譜聯用儀、原子吸收分光光度計、胺基酸分析儀、多功能生化分析儀、紫外分光光度計、螢光分光光度計、酶標儀、旋光儀、紅外分光光度計、水分測定儀、定氮儀、多用電泳儀、雙波長溥層掃瞄器、高速離心機、電子天平、真空抽提器等。
農業部淡水魚類種質監督檢驗測試中心濃厚的技術力量、先進的儀器設備和完善的質量管理體系，能夠面向全國所有與漁業相關的水產種質、漁業環境、無公害水產品、水產品中有毒有害物質與藥物殘留、漁用飼料、漁用藥物等業務的客戶提供以下服務：（ 1 ）承擔農業部或有關部門指定的行政執法和產品質量監督檢驗及優質產品的評選、複查、跟蹤檢驗；（ 2 ）受農業部或其他部門的委託，對實施證書管理（如生產許可證、質量認證、進出口登記、推廣許可證、產品登記、無公害食品、綠色食品等）的產品進行檢驗，對重要新產品、新品種投產和科技成果的鑑定進行檢驗；（ 3 ）承擔農業系統產品質量考核檢驗和產品質量的分等分級檢驗；（ 4 ）承擔有關產品質量的仲裁檢驗和其他委託檢驗（ 5 ）負責對農業系統有關企業和地方同類檢驗機構進行技術指導、技術諮詢、技術服務和人員培訓；（ 6 ）研究新的檢測技術和方法，承擔或參與國家標準、行業標準及地方標準的制修訂以及有關技術標準的試驗驗證工作；（7）承擔農業水產系統內的風險監測、評估、隱患排查及應對方案。
農業部淡水魚類種質監督檢驗測試中心將加強自身建設，遵照“科學、公正、廉潔、高效、服務”的質量監督工作方針，努力把中心辦成農業部提出的“產品質量評價中心、技術服務中心、市場信息交流中心、人才培訓中心”四位一體的質檢中心。
農業部淡水魚類種質監督檢驗測試中心近年來承擔的部級監測任務：
1、 農產品質量安全例行監測
2、 產地農產品質量安全監督抽查
3、 水產苗種質量安全監督抽查
4、 捕撈水產品質量安全監測
5、 漁用投入品質量安全隱患排查
6、 水產品質量安全跟蹤抽檢
7、 水產品質量安全風險監測
