衢州軍事管制委員會是衢州地方人民政府主管軍事管制的政府機構。
1949年5月6日，中國人民解放軍第二野戰軍十一軍、十六軍、十七軍和十八軍各部，由贛東北、皖南向浙西挺進，人民解放軍四十七師一百三十九團、一百四十一團分別渡過江山港、衢江，與人民解放軍四十八團師部，解放衢州城，共殲國民黨二0三師全部、第二團交警總隊一部共2000多人，繳獲汽車100多輛、迫擊炮23門、各種槍1200多支(挺)、槍彈94萬多發以及大量軍用物資。
5月6日，人民解放軍進入衢州城，受到廣大民眾的熱烈歡迎。衢州解放後，為保障人民財產安全，維持社會治安，防止反革命分子破壞，建立革命秩序，當日建立了軍事管制委員會，十六軍政治部主任吳實兼任軍管會主任。期間，衢州各縣也相繼解放並建立軍管會。常山縣城於5月4日解放後，當日建軍管會，四十七師政治部主任李樹榮兼任主任；江山縣於7日建軍管會，四十六師政委范陽春兼任主任；龍游縣於7日建立，三十二師副政委馬力兼任主任；開化縣於5月14日建立，五十四師政治部主任惠毅然兼任主任。軍管會為管制時期的最高權力機關，統一管理全城(縣)軍事與民政的各項事宜。衢州軍管會下設警備司令部和秘書、行政、教育、公安、交通5個處及物資管理委員會和工人工作委員會，十六軍中抽調排以上幹部200多人參加軍管會工作。
衢州軍管會自7日起接管國民黨衢縣縣政府及所屬行政機構和守職人員、財產、檔案、文書，並正式辦理移交手續，10日，衢州軍管會宣布沒收國民黨銀行、官僚資本企業。
為解決衢城居民日常生活用品購買難，粉碎敵人經濟破壞，平抑物價，軍管會成立了人民合作社，發出了通告，在衢城“中正堂”召開全城職工大會，組織工人學習，宣傳黨的方針政策和國際周邊形勢，提高他們的思想覺悟。
軍管會創辦了《衢州新聞》報為機關報。5月9日創刊，隔日出刊，共刊出8期，發行2000多份，23日停刊。還在原民眾教育館設大眾閱覽室和問事處。閱覽室內陳列革命書籍2000餘冊及淮海戰役圖片和渡江照片展覽供人觀看，開放以來，每天觀眾不絕。通過上述宣傳活動，使廣大市民對共產黨的方針政策有所了解，提高了思想認識。
衢州地區解放後，原隱蔽在農村的城工部黨員也即回城開展工作。5月10日，原城工部衢州中心支部黨員在衢城召開會議，建立城工部衢州臨時支部，選舉楊子清、張榮為正副書記，其它各縣也相繼建立了臨時工作委員會，協助軍管會接管城市、維持社會治安。衢城臨時支部還組織了“衢州學生聯合會”，以學聯名義宣傳城市政策和工商業政策，動員大批青年學生參軍。
5月23日，由吳實任主任的衢州軍管會及十六軍官兵奉命離開衢州進軍西南。
十六軍軍管會在衢州雖然只有短短的17天，但在維護衢州城市不受破壞、沒收官僚資本、接收國民黨偽政府及企業、動員企業復工、學校複課、商店開業等方面做了大量工作。17天裡，宣傳了新民主主義、中國共產黨的主張，新中國的曙光灑向了衢州人民的心頭，同時也為以燕明為書記的中共浙江省第三地方委員會的建立與城市的繼續接管打下了良好的基礎。
十六軍軍管會調離後，燕明兼任軍管會主任，新的領導班子組成。7月2日，浙江省人民政府第三專員公署正式建立，軍管會部分工作移交公署。
浙江省第三地委和第三專員公署的建立，標誌著中共衢州地方組織從此由隱蔽轉向公開，並以一級領導組織的面貌登上衢州歷史舞台，擔負起領導全地區人民開創新時代，建設新中國的歷史重任。
