螢光原位交合方法是一種物理圖譜繪製方法，使用螢光素標記探針，以檢測探針和分裂中期的染色體或分裂間期的染色質的雜交。螢光原位雜交(fluorescence in situ hybridization，FISH)是在20世紀80年代末在放射性原位雜交技術的基礎上發展起來的一種非放射性分子細胞遺傳技術，以螢光標記取代同位素標記而形成的一種新的原位雜交方法。
探針首先與某種介導分子(reporter molecule)結合，雜交後再通過免疫細胞化學過程連線上螢光染料。FISH的基本原理是將DNA(或RNA)探針用特殊的核苷酸分子標記，然後將探針直接雜交到染色體或DNA纖維切片上，再用與螢光素分子偶聯的單克隆抗體與探針分子特異性結合來檢測DNA序列在染色體或DNA纖維切片上的定性、定位、相對定量分析。
