蘇州大學東吳哲學研究所成立於2012年4月，為校級研究機構，目前掛靠蘇州大學政治與公共管理學院，依託蘇州大學哲學一級學科。李蘭芬教授任所長，米建國教授（台灣東吳大學）、邢冬梅教授任副所長。
蘇州大學東吳哲學研究所主要依託的蘇大哲學一級學科是我國最早獲得哲學碩士點單位之一（1979），是較早獲設馬克思主義哲學博士點（1998）、中國哲學博士點（2003）、哲學博士後流動站（2003）單位。2011年獲設哲學一級學科博士點。現有兩個省重點學科：馬克思主義哲學（2006）、中國哲學（2006）；一個國家暨省精品課程：馬克思主義哲學原理（2006、2007）；一個江蘇省國家重點學科培育點：馬克思主義哲學（2006）。
與蘇州大學哲學一級學科對應，蘇州大學東吳哲學研究所下設馬克思主義哲學研究室、中國哲學研究室、西方哲學研究室、倫理學研究室、宗教學研究室，科學技術哲學研究室、邏輯學研究室、城市哲學研究室、管理哲學研究室。
與當下學術研究發展的跨學科融合趨勢一致，蘇州大學東吳研究所認同“凸顯問題意義、淡化學科區分”，在人員組成與學術、學科活動中，積極吸納多學科、多維度資源。當下蘇州大學哲學學科既有的標誌性研究成果和持續地產生中的研究成果，正在塑造有特色的蘇州大學哲學研究東吳學派，已經受到學界同行的關注和認同。
蘇州大學東吳哲學研究所日常性的學術活動包括：1.每學期8至10次的哲學學術沙龍，每次由一位學者圍繞自己新近的較成熟的學術研究成果主題演講，多學科、多院系教師、學生參與討論。2.有計畫地組織申報或承接國家或地方的各類縱向和橫向項目，積極爭取在研究經費的支持以及研究成果的標誌性顯現上，塑造東吳哲學形象。3.積極擴大與國際及台灣、香港地區高校和科研機構的合作與交流，推進互邀講學、互邀訪學、聯合舉辦高水準的學術會議。4.積極參與高等院校人才培養的通識教育，努力培育並向全校推出品牌哲學教育課程。5.定期收集、整理、篩選哲學學科優秀的研究成果，並編輯出版。
