菊科蒲兒根屬的分子系統學研究

菊科蒲兒根屬的分子系統學研究

《菊科蒲兒根屬的分子系統學研究》是依託中山大學,由劉瑩擔任項目負責人的青年科學基金項目。

基本介紹

  • 中文名:菊科蒲兒根屬的分子系統學研究
  • 項目類別:青年科學基金項目
  • 項目負責人:劉瑩
  • 依託單位:中山大學
中文摘要,結題摘要,

中文摘要

蒲兒根屬屬於菊科千里光族,集中分布於我國。前期研究證明該屬是一個復系群,包括Sinosenecio群、蒲兒根群以及海南菊屬Hainanecio三群來源不同的植物。由於以往分子系統學研究中選用的分子標記自身固有的缺點以及分析方法不夠深入、透徹,該屬內Sinosenecio群和蒲兒根群與其近緣類群之間的系統關係未能得到解決,未能獲得較好的屬級分類處理方案,兩群植物內部的系統發育關係也不清楚。本項目針對以上問題,擬進行ITS序列的克隆測序和多個cpDNA片段的分析,並進行聯合分析。同時首次運用寡拷貝核基因進行蒲兒根屬的系統發育重建,澄清Sinosenecio群和蒲兒根群及其近緣類群的關係,以提出完善的屬級修訂方案,並試圖澄清這兩群內部的系統發育關係。本項目的開展對解決菊科千里光族的系統學問題極其重要,同時也能增加對中國-日本和中國-喜馬拉雅兩大植物區系的聯繫和分化問題的理解,具有重要的理論意義。

結題摘要

選取核基因ITS和ETS進行了分子系統學研究,囊括蒲兒根屬(Sinosenecio群和蒲兒根群)41種中的37種(90%)。在此基礎上,為解決Sinosenecio群與LCP複合體其他屬之間系統發育關係,選取7個葉綠體片段(matK-5'trnKUUU-3'rpS16、5'rpS16-trnQUUG-psbK、psbK-psbI-trnSGCU-trnCGCA-petN、ycf3-trnSGGA-rpS4、trnTUGU-trnLUAA-trnLUAA-trnFGAA-ndhJ、ndhC-trnVUAC、trnLUAG-rpL32-ndhF)對該複合體的植物中的126種(138居群)進行了系統發育分析。主要研究結果如下: (1)Sinosenecio群是廣義款冬亞族的成員。該群並非單系,在13個成員中,由分布於四川盆地西側7種(即雨農蒲兒根、腎葉蒲兒根、橐吾狀蒲兒根、圓葉蒲兒根、四川蒲兒根、蓮座蒲兒根和藝林蒲兒根)組成的單系得到了ITS、ETS和葉綠體片段分析的強烈支持;分布於四川盆地東側5種(即仙客來蒲兒根、川鄂蒲兒根、毛柄蒲兒根、單頭蒲兒根和紫毛蒲兒根)彼此近緣,其單系性質得到了ETS和葉綠體片段資料的支持,葉綠體片段的分析顯示,這一支為LCP複合體的基部類群;分布於大婁山脈的革葉蒲兒根,其系統位置在不同分析中有一定變化,系統位置未能確定。根據上述結果,蒲兒根屬的範圍應進一步縮小至僅含分布於四川盆地西側的7種。(2)蒲兒根群為廣義款冬亞族中狗舌草亞族的成員,與羽裂菊屬和狗舌草屬最為近緣。該群並非單系,其成員可分為兩群,其中18種(Sinosenecio 48-1)與羽裂菊屬的成員關係密切,聚成一單系群;其餘6種(即廣西蒲兒根、江西蒲兒根、九華山蒲兒根、白背蒲兒根、岩生蒲兒根和武夷山蒲兒根)聚成另一支(Sinosenecio 48-2)。在狗舌草亞族內,上述兩支的單系性質都受到了強烈支持,但它們之間的系統發育關係並不確定。在ITS分析中,兩者以很低的支持率聚成一支,而ETS分析顯示,兩者與狗舌草屬一支一起形成三岐分支。根據上述結果,Sinosenecio 48-1的18種(很可能也包括未納入本研究的4種,即光果蒲兒根、假光果蒲兒根、承經蒲兒根和三脈蒲兒根)應併入羽裂菊屬,而其餘6種的處理(劃入羽裂菊屬或獨立成屬)有待獲得更多數據之後進行分析。

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