《腦膠質瘤全基因組SNP晶片掃描篩選與EGFR相關聯基因的研究》是依託中山大學，由尹東擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名：腦膠質瘤全基因組SNP晶片掃描篩選與EGFR相關聯基因的研究
- 項目類別：面上項目
- 項目負責人：尹東
- 依託單位：中山大學
中文摘要,結題摘要,
中文摘要
我們利用SNP-Chip對腦膠質瘤全基因組拷貝數進行掃描，發現1p36.23和6q26-27 缺失分別占腦膠質瘤的35% 和27%。根據SNP-Chip分析結果，1p36.23和6q26-27最小公共缺失片段中僅分別包含三個基因（mir-34a、GPR157、H6PD）和四個基因(PARK2, PACRG, QKI, PDE10A)。有趣的是22%病例中EGFR基因擴增與1p36.23缺失同時發生，而且這部分病人的生存時間明顯縮短，因此我們提出1p36.23中的基因對EGFR基因有負調節作用的假設。初步的實驗結果顯示mir-34a對EGFR表達有負調節功能。本課題將研究mir-34a對EGFR的調節機制和GPR157、H6PD與EGFR的關係，以及以類似的方法研究6q26-27中的基因與EGFR基因的關聯性。如果能找到調控EGFR表達的新基因，將有助於進一步闡明腦膠質瘤的分子遺傳發病機制。
結題摘要
EGFR基因的異常是驅動很多腫瘤發生髮展的重要的分子因素。找到調控EGFR 表達的新基因，對研究腫瘤的治療將有重要意義。本研究首先對55 例腦膠質瘤（GBM）組織樣本和6 個GBM 細胞株中的DNA 進行了全基因組的SNP-Chip 掃描檢測，結果發現1p36.23和6q26-27是最小公共缺失片段，僅分別包含三個基因（mir-34a、GPR157、H6PD）和四個基因（PARK2、PACRG、QKI、PDE10A），而EGFR在腦膠質瘤是擴增率最高的基因，我們根據臨床表征確定這些缺失片段中的基因是否與EGFR的擴增存在相關性，並探索這些缺失基因對EGFR是否存在調控或被調控關係。我們進一步對531例惡性膠質瘤的affymetry SNP-CHIP數位化染色體型圖譜進行了整合分析，探索可能存在的EGFR的相關聯的基因。並且我們的研究結果揭示了：（1）EGFR擴增與1p36.23 片段缺失同時發生的患者與單獨EGFR擴增或單獨1p36.23 片段缺失相比生存時間最短；（2）EGFR受轉錄因子YY1的轉錄活化，mir-34a通過靶向YY1的mRNA的水平抑制EGFR的表達；（3）PARK2可通過多途徑抑制EGFR通路活性，一方面通過泛素化蛋白酶體途徑降解EGFR，一方面通過抑制EGFR的mRNA的表達水平。通過本課題的完成，我們發表了7篇有重要意義的SCI論文，並鑑定出來一些重要的參與腫瘤發生髮展的基因，為臨床診治和預後提供套用基礎。
