脊椎動物miRNA基因的起源與進化分析

《脊椎動物miRNA基因的起源與進化分析》是依託南京師範大學，由馬飛擔任項目負責人的面上項目。

基本介紹

• 中文名：脊椎動物miRNA基因的起源與進化分析
• 項目類別：面上項目
• 項目負責人：馬飛
• 依託單位：南京師範大學

項目摘要

本項目緊密圍繞脊椎動物進化和microRNA（miRNA）研究中的關鍵問題,擬從多學科交叉的角度系統地開展脊椎動物miRNA基因起源與分子進化研究。利用生物信息學技術開發最原始脊索動物海鞘和文昌魚miRNA基因的識別程式，並通過Northern 雜交技術對預測結果進行驗證，構建海鞘和文昌魚miRNA的cDNA文庫，克隆表達的miRNA並測序。在此基礎上，通過海鞘、文昌魚及脊椎動物miRNA基因結構特徵的比較與分析，揭示脊椎動物miRNA基因及基因家族的進化動力。進一步對脊椎動物miRNA基因及基因家族進行進化分析，探索脊椎動物miRNA基因及基因家族的分子進化規律，揭示脊椎動物miRNA基因起源與進化的可能機制。本項目的完成對揭示miRNA基因的起源與進化機制及其在RNA 調控體系中的規律和作用，以及為更深入地揭示RNA 調控體系的演化機制都具有重要的科學意義。

結題摘要

本項目緊密圍繞脊椎動物進化和microRNA（miRNA）研究中的關鍵問題，從多學科交叉的角度系統地開展脊椎動物miRNA 基因起源與分子進化研究。利用生物信息學技術開發最原始脊索動物文昌魚miRNA 基因的識別程式，構建文昌魚EST資料庫，克隆miRNA 並測序。在此基礎上，通過文昌魚及脊椎動物miRNA 基因結構特徵的比較與分析，揭示脊椎動物miRNA 基因及基因家族的進化動力。同時我們分別進行了miRNA寄主基因的進化研究、人類選擇性剪接基因的miRNA靶標分析、果蠅中重複元件與非重複元件序列上的miRNA靶位點特徵研究、海鞘新miRNA基因的識別及其靶標預測。進一步對脊椎動物miRNA 基因及基因家族進行進化分析，探索脊椎動物miRNA 基因及基因家族的分子進化規律，揭示脊椎動物miRNA 基因起源與進化的可能機制。另外，本項目對文昌魚先天免疫通路的中LITAF、GNBP、COMMD4、IKK、REL以及NFAT等基因，進行了克隆測序、表達模式以及進化功能分析，進一步完善了文昌先天性免疫的研究工作。本項目的完成對揭示miRNA 基因的起源與進化機制及其在RNA 調控體系中的規律和作用，以及為更深入地揭示RNA 調控體系的演化機制都具有重要的科學意義。