《胚胎相關基因HOXA13在食管癌細胞中下游靶基因的研究》是依託北京大學,由申潞艷擔任負責人的青年科學基金項目。
基本介紹
- 中文名:胚胎相關基因HOXA13在食管癌細胞中下游靶基因的研究
- 項目負責人:申潞艷
- 依託單位:北京大學
- 項目類別:青年科學基金項目
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
胚胎相關基因HOX基因是一組含39個成員,高度保守、成簇排列、具有時空共線性表達特徵的基因。HOX基因編碼一組轉錄因子,調控哺乳動物的胚胎髮育過程。近年來發現其在腫瘤中存在類似於AFP、CEA的返祖現象,發揮調節細胞增殖,凋亡,分化,轉移以及信號轉導的作用,但其所調節的下游基因仍不明確。前期研究工作中,我們發現11個HOX成員在食管癌中存在異常表達(相對於癌旁組織);其中HOXA13高表達預示患者生存時間較短,體內體外實驗提示HOXA13表達水平不同的食管癌細胞株在克隆形成率、裸鼠成瘤性方面存在差異;進而蛋白質組學和啟動子晶片研究篩選到一組可能受HOXA13調控的基因,它們參與細胞生長、調亡相關的通路。本研究擬對蛋白質組學和啟動子晶片研究中得到的潛在靶基因採用報告基因系統,染色質免疫共沉澱技術明確HOXA13促進細胞增殖的下游基因,為揭示HOXA13在食管癌中發揮的作用提供直接依據。
結題摘要
胚胎相關基因HOX基因是一組含39個成員,高度保守、成簇排列、具有時空共線性表達特徵的基因。HOX基因編碼一組轉錄因子,調控哺乳動物的胚胎髮育過程。近年來發現其在腫瘤中存在類似於AFP、CEA的“返祖現象”,發揮調節細胞增殖,凋亡,分化等作用,但其所調節的下游基因仍不明確。前期研究工作中,我們發現11個HOX成員在食管癌中存在異常表達;其中HOXA13高表達預示患者生存時間較短,體內體外實驗提示HOXA13表達水平不同的食管癌細胞株在克隆形成率、裸鼠成瘤性方面存在差異;進而蛋白質組學和啟動子晶片研究篩選到一組可能受HOXA13調控的基因。本研究對蛋白質組學和啟動子晶片研究中得到的潛在靶基因採用報告基因系統,染色質免疫共沉澱技術明確HOXA13促進細胞增殖的下游基因。另外,我們探討了HOXB7,HOXC6,HOXC8在食管癌組織中的表達以及對患者預後的意義,進而採用RNA干擾技術敲減它們的表達觀察對食管癌細胞生物學性狀的影響。結果顯示HOXA13在體外可影響SOD2,ANNX2,RAC1基因的啟動子區轉錄活性,在體內與HOXA13蛋白結合的基因並不含ANNXA2,SOD2,RAC1。值得注意的是,HOXA13蛋白可與TGF-b通路中的成員BMP和SMAD基因啟動子區結合。在細胞系EC109、EC9706、KYSE150、KYSE410與KYSE510中檢測了HOXA13及其潛在的靶基因SOD2、ANNX2的表達情況,同時檢測了23例食管癌及癌旁正常組織中前述三者的表達情況,結果發現HOXA13的表達與SOD2、ANNX2的表達存在正相關的關係(SOD2:r=0.503,p<0.001,ANNX2:r=0.878,p<0.001);進一步分別在兩組食管癌患者佇列中分析了HOXA13及其潛在靶基因SOD2及ANNX2的聯合預後價值,結果發現HOXA13與SOD2或ANNX2聯合比單一基因能更好得區分生存。HOXB7,HOXC6,HOXC8在食管癌組織中均有不同程度的表達,且高表達者預後差。在食管癌細胞中干擾HOXB7、HOXC6、HOXC8的表達後,細胞增殖能力下降,細胞凋亡增多,細胞周期阻滯在G1期,裸鼠成瘤能力下降。本研究深入探討了胚胎相關基因HOX家族成員對食管癌細胞的影響以及其表達對食管癌患者預後的意義,為HOX基因作為食管癌預後分子標記物提供了理論依據。