《肺腺癌中不同形態成分間演化關係及關鍵事件的研究》是依託北京大學，由楊帆擔任負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名：肺腺癌中不同形態成分間演化關係及關鍵事件的研究
- 項目負責人：楊帆
- 依託單位：北京大學
- 項目類別：面上項目
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
肺癌是國人第一位腫瘤殺手。闡明早期肺癌的演化過程，具有重大科學和臨床價值。隨著近年微量核酸建庫及測序等技術發展，多個腫瘤的演化研究取得突破，但肺癌研究仍滯後。根據新近國際發現和我們前期工作，參考其它腫瘤研究結果，我們提出假說：早期肺腺癌從浸潤前病變到浸潤癌的演化，不是傳統理論的漸進線性發展，而是類似其它腫瘤的間斷平衡進化。本課題計畫克服現有肺癌研究中形態成分取材粗糙、測序分析簡單等不足，並增加轉錄組測序，由北京大學人民醫院胸外科進行病例和標本採集，經病理醫師選取典型區域行顯微切割後，由北京大學生物動態光學成像中心採用多重退火和環化循環的擴增技術(MALBAC)進行核酸擴增建庫，採用最新最準的Illumina HiSeq X Ten平台進行全外顯子組和轉錄組測序；隨後完成單核苷酸多態性、染色體重組、基因拷貝數變化和轉錄組差異分析，描繪進化樹，明確肺腺癌不同形態成分間的演化關係，以及關鍵事件。
結題摘要
本研究的目的在於揭示早期肺腺癌從浸潤前病變到浸潤癌的演化過程，以期發現其進展過程中的關鍵基因事件。通過全外顯子測序技術明確了極早期肺腺癌中磨玻璃（GGO）（非浸潤）成分和實性（浸潤）成分之間的差異。測序結果顯示混合密度GGO這一早期肺癌中即已經存在明顯的異質性和分支進化現象（branched evolution）。此外，我們還發現同一病灶中，實性成分和GGO成分中腫瘤突變負荷(TMB)類似，而且實性成分和GGO成分之間沒有各自顯著富集的突變基因，即GGO向浸潤癌的轉化不是通過基因組水平突變產生。通過GGO病灶單細胞轉錄組測序，並與正常肺組織、浸潤肺腺癌單細胞轉錄組數據對比，發現GGO較正常肺組織的T細胞浸潤增多，髓系細胞減少。此外GGO中的成纖維細胞表達譜與正常組織無明顯差別，但血管內皮細胞與浸潤腺癌更相似。這說明，早期肺腺癌演化不僅僅是腫瘤細胞本身。
