《肺炎支原體相關非編碼RNA的篩選和鑑定》是依託復旦大學，由劉楊擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名：肺炎支原體相關非編碼RNA的篩選和鑑定
- 依託單位：復旦大學
- 項目類別：面上項目
- 項目負責人：劉楊
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
申請人前期工作結果顯示：一、肺炎支原體p1基因變異度較大；二、肺炎支原體對大環內酯類耐藥高度流行與克隆傳播無關；三、肺炎支原體在環境因素改變時致病基因存在轉錄組水平的調控。上述研究結果提示針對肺炎支原體自身生物學調控以及與宿主間相互作用等表觀遺傳學特徵的基礎研究成為下階段工作的重點。本次申請的連續課題擬從肺炎支原體轉錄組水平著手，以非編碼RNA為切入點，初步探索肺炎支原體自身調控以及與宿主間相互調控的機制。研究第一部分擬對肺炎支原體自身小RNA（sRNAs）進行生物學預測、篩選、鑑定及初步功能研究，將有助於更全面和系統的認識肺炎支原體自身基因表達調控網路；第二部分擬構建肺炎支原體感染正常人肺上皮細胞模型，利用微小RNA（miRNAs）晶片篩選並檢測感染前後肺上皮細胞的miRNA表達譜變化，並探索差異表達的作用機制。本研究對於進一步闡明肺炎支原體基本生物學特性和遺傳變異規律具有重要意義。
結題摘要
肺炎支原體在自身進化以及與人類宿主相互作用的過程中，相互構成了一個複雜的網路，以精細調控肺炎支原體感染的免疫反應，但確切免疫調控機制仍不清楚。肺炎支原體全基因測序已完成，為進一步進行上述研究提供了良好基礎。本課題從肺炎支原體轉錄組水平著手，以非編碼RNA為切入點，初步探索肺炎支原體自身調控以及與宿主間相互調控的機制，對於進一步闡明肺炎支原體基本生物學特性和遺傳變異規律具有重要意義。目前已利用RNAseq及生物信息學分析軟體兩種不同的方法對P1 型Ⅰ和Ⅱ型肺炎支原體代表菌株( MP M129和MP FH) 的sRNAs、tRNA及rRNA進行預測和篩選，並對sRNA的靶標mRNA進行相關預測，並設計引物開展對其進行鑑定，有助於更全面和系統的認識肺炎支原體自身基因表達調控網路。目前已完成人正常肺上皮細胞BEAS-2B感染肺炎支原體模型的建立，並建立了提純RNA的方法，樣本已進行RNAseq；與國內世界領先的基因組學中心生物信息學分析單位深圳華大基因研究院建立合作，對人正常肺上皮細胞BEAS-2B感染肺炎支原體模型後細胞、肺炎支原體相關部分信號通路分析進行研究價值評估；篩選出研究價值較大的信號通路分子，參考國內外文獻，並對肺炎支原體感染人支氣管上皮細胞BEAS-2B中P53/RGS13通路的作用機制展開研究。研究表明，肺炎支原體感染可能誘發非凋亡途徑傷害，肺上皮細胞細胞採用降低凋亡的保護策略來對抗肺炎支原體的感染；肺上皮細胞可通過下調 P53 並進一步上調 RGS13 的方式在一定程度上減弱 Mpn 導致的炎症反應，起到對細胞和組織的保護作用。
