聯合國愛滋病規劃署於1996年初在華設立辦事處。
聯合國愛滋病規劃署全面參與在華的有關愛滋病的監測、倡導和培訓活動。
聯合國愛滋病規劃署的工作職責是加強國家應對愛滋病的能力，確保長期持續地採取行動應對愛滋病的流行。
聯合國愛滋病規劃署於1996年初在華設立辦事處，位於北京東外大街亮馬河南路14號塔園外交辦公大樓1-162號。
聯合國愛滋病規劃署的十個共同發起機構（聯合國難民事務高級專員署、聯合國兒童基金會、世界糧食計畫署、 聯合國開發計畫署、聯合國人口基金、聯合國毒品與犯罪事務辦公室、國際勞工組織、聯合國教科文組織、 世界衛生組織、世界銀行）都以各自的方式全面參與在華的有關愛滋病的活動。 特別是世界衛生組織，聯合國開發計畫署和聯合國兒童基金會已經與中國合作了許多項目，如監測、倡導和培訓等。
在聯合國駐華協調員的支持下，正式成立了聯合國愛滋病中國專題組，專題組在華工作順利。專題組不只局限於聯合國在華機構，它鼓勵政府、雙邊援助機構和非政府組織參與專題組的活動。專題組每月召開一次會議。
專題組的工作職責與聯合國愛滋病規劃署關注的重點是一樣的，即加強國家應對愛滋病的能力，確保長期持續地採取行動應對愛滋病的流行。為實現這些目標，專題組的主要活動包括加強十個共同發起機構間的合作，採取一致行動，一起開展監測和評估；向國內有關機構提供技術支持，廣泛宣傳國際上的先進經驗； 促進中國領導對愛滋病工作的協調和監測；倡導政府進一步作出承諾，動員多部門參與，以及共同合作動員更多的資源投入。
專題組的工作具體由聯合國愛滋病規劃署駐華辦事處國家協調員，以及辦事處的官員及工作人員負責。聯合國愛滋病規劃署駐華辦事處積極參與擴展愛滋病工作的夥伴網路，因為防治愛滋病需要各部門的參與，以及跨部門合作往往會遇到困難。聯合國愛滋病規劃署駐華辦事處向在華開展愛滋病防治工作的夥伴提供技術、政策及管理方面的建議，主要是推廣全世界上以往和現行的應對愛滋病流行的先進經驗。
中國是聯合國愛滋病規劃署最高行政機構“規劃協調委員會”最早的成員國之一，也是第一個向該組織捐款的開發中國家。自聯合國愛滋病規劃署開始在中國工作的兩年時間裡，由駐華發起組織、一些友好國家、國際非政府組織和我國政府代表參加的聯合國愛滋病規劃中國專題組例會機制運轉良好。通過這一機制，聯合國駐華機構和有關方面的愛滋病防治活動得到了較好的協調和促進，多部門和民眾組織對愛滋病防治工作的參與也在這一機制的支持下進一步發展。
1997年聯合國愛滋病規劃中國專題組和衛生部成功地進行了國家愛滋病現狀和需求調查，由此而產生的報告和繼而在1998年年初召開的國際捐款會為加強國際合作和動員更多的國際資源起到了較好的宣傳和促進作用。
在1996-1997財政年度，聯合國愛滋病規劃署還以設立核心基金和項目發展特別基金的方式直接促進中國的愛滋病防治事業。在1998-1999年中，聯合國愛滋病規劃署將通過戰略規劃基金的方式與中國衛生部和有關機構密切合作，協助制訂省級愛滋病防治戰略規劃，以更好地實現中國愛滋病防治中長期規劃所制定的目標。
聯合國愛滋病規劃署駐華辦事處在華的主要職責是協調和提供支持，積極開展倡導和資源動員工作，以便資助並支持中國的愛滋病防治活動。
儘管聯合國愛滋病規劃署駐華辦事處向中國的愛滋病防治工作提供支持，促進協調，但並不是替代中國政府的工作。相反，是中國政府負責愛滋病工作的全面協調工作，包括各級有關工作的協調，以及來自聯合國及聯合國愛滋病規劃署等外界援助。
衛生部是指定的多部門協調單位，也是聯合國愛滋病規劃署駐華辦事處的政府歸口協調單位。 國家成立了由各部門高層領導組成的多部門協調委員會，委員會在國務院的領導下定期召開會議。委員會成員有衛生部、外交部、商務部、鐵道部、公安部、教育部、全國婦聯等。委員會是聯合國愛滋病中國專題組的國家對口單位。
