系統科學哲學指的是科學技術哲學分支之一。研究系統科學中的哲學問題的一門學科。介於哲學與系統科學之間的邊緣學科。隨現代系統科學的建立而產生。系統科學具有“元科學”、“方法論”或哲學方面的性質。1972年，貝塔朗菲在《一般系統論的歷史和現狀》一文中指出，系統科學哲學是由於系統成為新的科學規範(區別於古典科學的分析性的、機械論的、線性因果關係的規範)而產生的世界觀方面的變化。
系統科學哲學的研究內容主要有兩個方面：(1)系統本體論。主要研究一切系統的共同特徵和規律,說明系統的本質，各種系統在被觀察的世界的各級水平上的體現，從而構造出一個系統世界的理論模型。(2)系統認識論和系統方法論。即將系統思想運用於認識論，研究認識系統特別是認識複雜系統的方法論原則，諸如整體綜合性原則、組織結構性原則、功能自主性原則、層次有序性原則等等。
