簡約性信息位點

簡約性信息位點(parsimony-informative site)指基於DNA或蛋白質序列、利用最大簡約法構建系統發育樹時,在兩個及以上分類單元(的序列)中存在差異,且其中至少有兩種變異類型在該位點出現兩次及以上,此類位點稱為簡約性信息位點。

基本介紹

  • 中文名:簡約性信息位點
  • 外文名:parsimony-informative site
  • 基礎:DNA或蛋白質序列
  • 利用最大簡約法
簡約性信息位點(parsimony-informative site)指基於DNA或蛋白質序列、利用最大簡約法構建系統發育樹時,在兩個及以上分類單元(的序列)中存在差異,且其中至少有兩種變異類型在該位點出現兩次及以上,此類位點稱為簡約性信息位點。所有分類單元中狀態恆定的位點和只出現一次的變異的位點都是非簡約性信息位點。
例如,分析以下5條DNA序列(a、b、c、d、e)的5個位點:
a A G G C T
b A C G C T
c A C G G T
d A T G G A
e A A T T A
其中,位點1沒有發生突變,為保守性位點。位點2雖然產生突變,但只有C出現兩次,因此不是簡約性信息位點。位點3同樣產生了突變,但是只有G出現了兩次以上,同樣不是簡約性信息位點。位點4發生了突變,且C和G各出現了兩次,是簡約性信息位點。位點5發生了突變,且T出現了3次,A出現了兩次,因此該位點是簡約性信息位點。

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