第2次超級機器人大戰Z 破界篇

故事背景

原本沒有交集的多個平行世界，因為大時空震動的緣故，分隔它們的壁壘被輕易的破壞了。於是，各個平行世界通過分裂和融合，產生了數個多元世界。

故事發生在這些世界之一的地球。大時空震動發生20年之後，世界在秩序下逐漸形成了社會，但是，局勢還遠沒有回覆平穩。大國之間圍繞著霸權展開的互相對峙，小國之間的紛爭，政府軍和抵抗組織的衝突，地球國家和宇宙殖民地的對立，恐怖主義橫行... 而且，人類還面臨著共同的敵人，不時從異次元出現的神秘生命體，次元獸。而被人們認為是自然災害的次元獸，它們造成的破壞正在逐年遞增。

儘管許多人懷著不安和憤怒的火種，今天的世界依然不斷地前進。未來等待著的，是一場稱為變革的戰鬥風暴...

某日，欠下巨額借款的男人克羅烏・布魯斯托，為了高額的報酬而成為對次元獸用機動兵器普拉斯達（ブラスタ）的測試駕駛員。為了替普拉斯達收集戰鬥數據，克羅烏與各方勢力接觸。“使用武力根絕戰爭”為目的的天人、新能源“光子力”為動力的超級機器人・魔神Z、新的異世界轉移過來的宇宙移民船團的民間軍事組織S.M.S、以解放布里塔尼亞支配下（部份）的日本為目的的黑色騎士團……。他們各有不同的理念，在國連平和維持理事會代表艾魯坎‧羅迪克呼召下特別國際救助隊ZEXIS結成。克羅烏亦是其中一員。

與世界各地恐怖份子及人類共通的脅威次元獸對抗的ZEXIS，除了要應付三大國家潛伏的陰謀外，還有怪人艾姆‧萊伊哈特在暗處阻撓克羅烏。此時，小國利摩涅西亞所引起的時空災害“災難之浴（カラミティ・バース）”，導致統領次元獸的破界之王‧凱歐烏來到這個世界。在其壓倒性的力量前ZEXIS亳無反擊之力，被迫撤退。凱歐烏和他的跟隨者發表“新帝國英佩利姆”的建國宣言，並隨意的重複進行破壞活動。

在災難之浴的影響下除了凱歐烏下，從惡魔之手中守護了各個多元世界的戰士們ZEUTH也被呼召到這個世界。與ZEUTH的成員成為同伴後的ZEXIS戰力增強，已準備升起對英佩利姆反擊的狼煙了。