第一次亞非會議以後，國際形勢發生了複雜的變化，在帝國主義和殖民主義的挑撥離間下，一些國家之間又起了衝突，使亞非團結受到嚴重干擾。在費盡周折之後，1964年4月10日至15日，在印尼總理蘇加諾的積極倡導和亞非一些國家的支持下，第二次亞非會議的籌備會終於在印尼的雅加達召開，並通過了《最後通告》，決定第二次亞非會議在1965年3月10日召開。
但是由於西方國家的不斷阻撓，第二次亞非會議一推再推，政治中心在歐洲的蘇聯竟然想要擠進亞非會議，一些國家也蓄意破壞亞非國家之間的團結，這也給亞非會議的正常召開設定了阻力。最終由於原定的東道主國家阿爾及利亞發生政變而擱淺。
四十年後，2005年4月22日至23日在雅加達舉行第二次亞非會議，探討加強兩大洲在多個領域裡合作的問題。
