福建省人民檢察院第二檢察部是福建省人民檢察院內設機構。負責對法律規定由福建省人民檢察院辦理的危害國家安全、公共安全犯罪,故意殺人、搶劫、毒品等犯罪案件的審查逮捕、審查起訴、出庭支持公訴、抗訴,開展相關立案監督、偵查監督、審判監督以及相關案件的補充偵查。辦理福建省人民檢察院管轄的相關刑事申訴案件。