神經節段選穴法是根據疼痛和感覺障礙的部位與神經節段分布選取穴位的方法。人體胚胎早期，身體由排列均等的體節組成，每個體節分成三部分，即軀體部(形成未來的皮膚、肌肉、骨骼)、內臟部(形成未來的內臟)、神經節段(形成未來的神經系統)。在每個原始節段中，神經節段向其他兩個部分發出軀體神經和內臟神經，從而形成一個機能性局部單位。隨著胚胎的發育，軀體部向遠端伸展為四肢，內臟部變為管狀或實質性器官，神經節段逐漸變成保持階段狀的脊髓和留有階段痕跡的腦幹以及超分節的高位神經中樞。在軀體和內臟的神經分布仍保持著原始階段的支配，在相應的節段里仍發生著直接或間接的聯繫。內臟有病變能反應到相應的體表，而體表的機能變化，也能影響到相同節段的內臟。根據這種理論，某臟器發生病變，就可在與其相應神經節段的神經根部進行針刺。如上肢橈側疼痛，可取頸五至八夾脊穴；上肢尺側疼痛可選取胸一至二夾脊穴。
