《神經母細胞瘤DHRS4基因選擇性剪接機制研究》是依託汕頭大學，由黃東陽擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名：神經母細胞瘤DHRS4基因選擇性剪接機制研究
- 項目類別：面上項目
- 項目負責人：黃東陽
- 依託單位：汕頭大學
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
輔酶II依賴性視黃醇脫氫/還原酶(NRDR)由申請者首先純化並鑑定，其編碼基因DHRS4在神經母細胞瘤(neuroblastoma，NB)中存在異常的轉錄與剪接現象，提示NB細胞可能存在特殊的轉錄輔助因子和/或RNA剪接因子。申請者擬套用免疫沉澱、DNA親合層析、染色質免疫沉澱、轉染、RNAi等技術，研究神經母細胞瘤細胞中DHRS4的轉錄和剪接機制，鑑定出NB中存在的異常轉錄輔助因子和/或RNA剪接因子，驗證它們與NB發生的相關性，轉錄輔助因子和/或RNA剪接因子的異常與神經母細胞瘤的發生相關。課題研究結果除可以為NB的發生提供新的理論依據外，鑑定出的轉錄輔助因子和/或RNA剪接因子還有可能成為NB診斷、治療的新靶點，具有較強的潛在套用價值。
結題摘要
DHRS4基因編碼的蛋白NRDR是NADP(H)依賴的視黃醇氧化還原酶，本課題主要研究了DHRS4基因簇的選擇性剪接亞型及轉錄相關的剪接調控因子。課題首先通過RT-PCR和蛋白質譜鑑定了DHRS4基因選擇性剪接亞型編碼的蛋白，以及亞型NRDRB1作為氧化還原酶對不同底物的催化活性。經過生物信息學分析比對課題組和資料庫登錄的DHRS4基因簇的剪接亞型，發現exon a剪接缺失的規律，並推測選擇性啟動子的剪接位點以及反義RNA可能參與DHRS4L2和DHRS4L1基因exon a剪接缺失。最後通過RNA干擾、實時定量PCR、染色質免疫共沉澱技術驗證DHRS4自然反義轉錄本AS1DHRS4作為長的非編碼RNA，在表觀遺傳學水平通過DNA甲基化和組蛋白修飾調控DHRS4、DHRS4L2和DHRS4L1基因的轉錄起始活性。
