白林泉

男，1971年8月出生，博士，上海交通大學微生物學教授，博士導師，基金委“重要微生物合成與分解代謝的分子機理”創新研究群體和微生物代謝國家重點實驗室研究骨幹。

基本介紹

• 中文名：白林泉
• 國籍：中國
• 民族：漢
• 出生日期：1971年8月
• 職業：教授
• 畢業院校：華中農業大學分子生物學專業
• 主要成就：井岡黴素/有效黴素的生物合成

個人簡歷

教育經歷

1992年獲得山東大學微生物系學士學位。

1995年獲得華中農業大學微生物專業碩士學位。

1998年獲得華中農業大學分子生物學專業理學博士學位。

工作經歷

1999年至2002年4月在美國華盛頓大學化學系從事博士後研究。之後回國到上海交通大學生命科學技術學院工作。2006年至2007年初在德國Tuebingen大學微生物研究所從事生物合成調節方面的合作研究。

研究領域

研究成果

主要從事抗腫瘤安絲黴素、抗水稻紋枯病井岡黴素等微生物藥物的生物合成機理研究、合成生物學結構改造和功能基因組學研究，在PNAS、JACS、NPR、Chemistry & Biology、AEM、Chembiochem等雜誌發表50篇研究論文，其中第一作者及通訊作者20篇。研究成果被Nature Biotechnology、Nature China、Faculty of 1000 Biology等專文評價，被評為06年“中國高等學校十大科技進展”、07年“教育部自然科學二等獎”和08年“國家自然科學二等獎”。07年應邀在第14屆國際放線菌大會、08年在第13屆國際生物技術大會做分組報告。承擔和參加了國家自然科學基金4項及國家863計畫項目2項。07年入選教育部“新世紀優秀人才支持計畫”，08年入選上海市教委“曙光人才計畫”,09年獲得“明治乳業生命科學獎”和“第十一屆中國青年科技獎”。

研究方向

1、井岡黴素/有效黴素的生物合成

抗水稻紋枯病氨基環醇井岡黴素是重要的農用抗生素，也是我國開發最為成功的抗生素之一。在前期研究中，我們克隆了井岡黴素的生物合成基因簇並建立了產生菌的遺傳作業系統。在此基礎上，我們正在開展結構基因的功能、井岡黴素產生的溫度調節和代謝工程產量提高方面的研究。井岡黴素產生菌的基因組學研究也在進行之中。

2、安莎類抗生素的生物合成機理與組合生物合成改造

安莎類抗生素是一類大環內醯胺類聚酮化合物，包含利福黴素、格爾登素、安絲菌素、萘黴素等，具有抗腫瘤、抗結核桿菌、抗細菌等多種生理活性。安莎類抗生素在基本骨架的合成方面具有一定相似性，產生了部分結構相似區域，但相互之間也存在較大差異，如不同的後修飾反應等。我們以安絲菌素和萘黴素為研究材料，正在開展安莎類抗生素的合成後修飾機理及其在組合生物合成中的套用、安莎環的環化與釋放、複雜的生物合成調控機制等研究。

3、次生代謝產物生物合成基因資源挖掘

充分利用我國豐富的微生物資源和基因簇克隆的大量成果，通過關鍵結構基團合成基因保守區設計兼併性引物，通量篩選可能的次生代謝生物合成基因簇，然後以此為指導尋找目標化合物，建立化合物和合成基因資源庫。

發表論文

代表性論文（*通訊作者）

22: Zheng L, Zhou X, Zhang H, Ji X, Li L, Huang L, Bai L*, Zhang H*. Structural and functional analysis of validoxylamine A 7'-phosphate synthase ValL involved in validamycin A biosynthesis. PLoS One. 2012, 7(2):e32033.

21: Wang B, Kang Q, Lu Y, Bai L, Wang C. Unveiling the biosynthetic puzzle of destruxins in Metarhizium species. Proc Natl Acad Sci U S A. 2012, 109(4):1287-92.

20: Li Y, Zhao P, Kang Q, Ma J, Bai L*, Deng Z. Dual carbamoylations on the polyketide and glycosyl moiety by asm21 result in extended ansamitocin biosynthesis. Chem Biol. 2011, 18(12):1571-80.

19: Kang Q, Shen Y, Bai L*. Biosynthesis of 3,5-AHBA-derived natural products. Nat Prod Rep. 2012, 29(2):243-63.

18: Jiang C, Wang H, Kang Q, Liu J, Bai L*. Cloning and characterization of the polyether salinomycin biosynthesis gene cluster of Streptomyces albus XM211. Appl Environ Microbiol. 2012, 78(4):994-1003.

17: Zhou X, Wu H, Li Z, Zhou X, Bai L*, Deng Z. Over-expression of UDP-glucose pyrophosphorylase increases validamycin A but decreases validoxylamine A production in Streptomyces hygroscopicus var. jinggangensis 5008. Metab Eng. 2011, 13(6):768-76.

16: Kang Q, Bai L*, Deng Z. Toward steadfast growth of antibiotic research in China: From natural products to engineered biosynthesis. Biotechnol Adv. 2011.

15: Qiu J, Zhuo Y, Zhu D, Zhou X, Zhang L, Bai L*, Deng Z. Overexpression of the ABC transporter AvtAB increases avermectin production in Streptomyces avermitilis. Appl Microbiol Biotechnol. 2011, 92(2):337-45.

14: Wu Y, Kang Q, Shang G, Spiteller P, Carroll B, Yu TW, Su W, Bai L*, Floss HG. N-methylation of the amide bond by methyltransferase asm10 in ansamitocin biosynthesis. Chembiochem. 2011, 12(11):1759-66.

13: Wu Y, Kang Q, Shen Y, Su W, Bai L*. Cloning and functional analysis of the naphthomycin biosynthetic gene cluster in Streptomyces sp. CS. Mol Biosyst. 2011, 7(8):2459-69.

12: Wu Q, Liang J, Lin S, Zhou X, Bai L*, Deng Z, Wang Z*. Characterization of the biosynthesis gene cluster for the pyrrole polyether antibiotic calcimycin (A23187) in Streptomyces chartreusis NRRL 3882. Antimicrob Agents Chemother. 2011, 55(3):974-82.

11: He Y, Sun Y, Liu T, Zhou X, Bai L*, Deng Z. Cloning of separate meilingmycin biosynthesis gene clusters by use of acyltransferase-ketoreductase didomain PCR amplification. Appl Environ Microbiol. 2010, 76(10):3283-92.

10: Xu H, Zhang Y, Yang J, Mahmud T*, Bai L*, Deng Z. Alternative epimerization in C(7)N-aminocyclitol biosynthesis is catalyzed by ValD, a large protein of the vicinal oxygen chelate superfamily. Chem Biol. 2009, 16(5):567-76.

9: Zhang Y, Bai L*, Deng Z. Functional characterization of the first two actinomycete 4-amino-4-deoxychorismate lyase genes. Microbiology. 2009, 155(Pt 7):2450-9.

8: Zhou Y, Meng Q, You D, Li J, Chen S, Ding D, Zhou X, Zhou H*, Bai L*, Deng Z. Selective removal of aberrant extender units by a type II thioesterase for efficient FR-008/candicidin biosynthesis in Streptomyces sp. strain FR-008. Appl Environ Microbiol. 2008, 74(23):7235-42.

7: Xu H, Yang J, Bai L*, Deng Z, Mahmud T*. Genetically engineered production of 1,1'-bis-valienamine and validienamycin in Streptomyces hygroscopicus and their conversion to valienamine. Appl Microbiol Biotechnol. 2009, 81(5):895-902.

6: Zhao P, Bai L*, Ma J, Zeng Y, Li L, Zhang Y, Lu C, Dai H, Wu Z, Li Y, Wu X, Chen G, Hao X, Shen Y*, Deng Z, Floss HG. Amide N-glycosylation by Asm25, an N-glycosyltransferase of ansamitocins. Chem Biol. 2008, 15(8):863-74.

5: Zhang X, Fen M, Shi X, Bai L*, Zhou P*. Overexpression of yeast S-adenosylmethionine synthetase metK in Streptomyces actuosus leads to increased production of nosiheptide. Appl Microbiol Biotechnol. 2008, 78(6):991-5.

4: Minagawa K, Zhang Y, Ito T, Bai L*, Deng Z, Mahmud T. ValC, a new type of C7-Cyclitol kinase involved in the biosynthesis of the antifungal agent validamycin A. Chembiochem. 2007, 8(6):632-41.

3: Deng Z, Bai L*. Antibiotic biosynthetic pathways and pathway engineering--a growing research field in China. Nat Prod Rep. 2006, 23(5):811-27.

2: Bai L, Li L, Xu H, Minagawa K, Yu Y, Zhang Y, Zhou X, Floss HG, Mahmud T, Deng Z*. Functional analysis of the validamycin biosynthetic gene cluster and engineered production of validoxylamine A. Chem Biol. 2006, 13(4):387-97.

1: Yu TW, Bai L, Clade D, Hoffmann D, Toelzer S, Trinh KQ, Xu J, Moss SJ, Leistner E, Floss HG*. The biosynthetic gene cluster of the maytansinoid antitumor agent ansamitocin from Actinosynnema pretiosum. Proc Natl Acad Sci U S A. 2002, 99(12):7968-73.。