早年經歷
1912年，畑中健二出生在
京都一個地主家庭，為家中次男。
昭和9年（1934年）6月畢業於
陸軍士官學校第46期，同年6月進入野戰炮兵部隊服役。後來又先後在陸軍炮工學校與
陸軍大學校學習。1940年(昭和15年)6月、陸軍大學校(53期)畢業。
期間與同受
皇國史觀影響甚大的井田正孝與竹下正彥成為好友。
太平洋戰爭爆發後，作為參謀參加戰爭，在1942年3月出征
菲律賓不久後負傷。同年7月回到日本，8月升為陸軍少佐，先後在
陸軍省兵務局兵備科、軍務局軍務課擔任課員。
宮城事件
由於對日本政府決定接受
波茨坦宣言不滿，畑中等人在1945年8月策劃了旨在阻止天皇
終戰詔書播送和日本投降的
宮城事件。由於需要
近衛師團的支持，畑中等人前往其師團部，試圖說服近衛師團長
森赳。由於森拒絕參與政變，畑中突然向森開槍並與同謀一道將其殺害。此後，畑中等人切斷了
皇居並花費了數小時時間在其中搜尋天皇的終戰詔書錄音盤，以阻止其在第二天通過
NHK向全國廣播。在搜尋無果和東部軍開始介入的情況下，畑中最終放棄了政變企圖。並在8月15日午前與同謀椎崎二郎在
二重橋前的草地上一同開槍自殺。在他的口袋內找到了留下的辭世句：“聖世烏雲散，我心無所悔（今はただ思ひ殘すことなかりけり 暗雲去りし御世となりなば）
