《用cDNA微陣列研究鼻咽癌基因表達譜及相關基因克隆》是依託中南大學,由何志巍擔任項目負責人的青年科學基金項目。
基本介紹
- 中文名:用cDNA微陣列研究鼻咽癌基因表達譜及相關基因克隆
- 項目類別:青年科學基金項目
- 項目負責人:何志巍
- 依託單位:中南大學
- 批准號:39900174
- 申請代碼:H1801
- 負責人職稱:教授
- 研究期限:2000-01-01 至 2002-12-31
- 支持經費:12(萬元)
《用cDNA微陣列研究鼻咽癌基因表達譜及相關基因克隆》是依託中南大學,由何志巍擔任項目負責人的青年科學基金項目。
《化學因素致鼻咽癌相關基因NOR1的功能進一步研究》是依託中南大學,由聶新民擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要 硝基還原酶基因NOR1是本室克隆的一個與亞硝胺類化合物形成相關的基因。本研究擬利用NOR1基因單核苷酸多態性(SNP)標誌在鼻咽癌家系中的遺傳連鎖分析及其突變在家系和人群中的分布從分子水平考察NOR...
白血病、膠質瘤)細胞的誘導分化效應;套用cDNA微陣列技術檢測誘導分化前後腫瘤細胞分化相關基因表達的變化;用隨機引物差異顯示PCR分離差異表達基因;並以反Northern雜交驗證;再進行PCR擴增、基因克隆、鑑定、測序,與GenBank對比分析差異相關基因信息,以期發現丹參酮ⅡA作用的靶基因,探討丹參酮ⅡA誘導腫瘤分化的分子機理...
《cDNA微陣列基因表達譜遺傳模型構建與分析方法的研究》是依託浙江大學,由朱軍擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 晶片技術是實驗分子生物技術的一個重大突破,近年來晶片技術日益成為研究高通量基因表達連續變化的實驗室工具。.本研究擬發展表達譜基因晶片數據分析方法,包括基因差異表達分析、時間序列的條件分析和聚類...
基因表達譜(gene expression profile):指構建處於某一特定狀態下的細胞或組織的非偏性cDNA文庫,通過大規模的cDNA測序,收集cDNA序列片段、定性、定量分析其mRNA群體組成,從而描繪該特定細胞或組織在特定狀態下的基因表達種類和豐度信息,這樣編製成的數據表就稱為基因表達譜。基因概述 基因表達譜的獲得與表示 在基因...
首先建立了寡核苷酸引物介導的人類高分辨染色體顯微切割和顯微基因克隆技術;已建立的17種染色體特異性DNA文庫和24種染色體區特異性DNA文庫及其探針;構建了人X染色體YAC圖譜,已完成了人X染色體Xp11.2-p21.3跨度的約35cM STS-YAC圖譜的構建;建立了YAC-cDNA篩選技術。目前的研究工作還包括: 疾病和功能相關新基因的...
通過核酸和蛋白印跡法測定各級星形腦膠質瘤中轉錄因子TFⅡB的表達,結合微陣列預研結果,確定在膠質瘤惡變過程中TFⅡB的表達變化規律;通過導入TFⅡB及反義基因,改變TFⅡB在瘤細胞株中的表達,並通過微陣列等方法觀察TFⅡB表達改變引起的基因表達譜、瘤細胞體內外特性的改變。試圖對TFⅡB這一重要轉錄因子在膠質瘤中的...
2.解析度高 ●最高可達5μm ●多種解析度可調:5μm、10μm、20μm、40μm 3.靈敏度高 ●可達0.1個螢光分子/μm2。主要功能 套用於高、中、低密度微陣列晶片的雙色或單色螢光檢測分析:生命科學研究,如DNA甲基化檢測、基因表達譜分析; 臨床檢驗,如自身免疫性疾病檢測、細菌鑑定與耐藥檢測。
此外,基因組學技術也將為飼料安全性評價、病原菌檢測、摻雜及使偽甄別提供強有力的手段。2、闡明動物營養需要量的分子生物標記。套用含有某種動物全部基因的cDNA晶片研究在營養素缺乏、適宜和過剩條件下的基因表達圖譜,將發現更多的、能用來評價營養狀況的分子標記物。現有的營養需要量均非根據基因表達確定,僅有極...
用此法即可看出正常細胞和病變細胞中表達基因在種類和水平上的差異,同時還可能從基因表達圖的特別處發現新的基因。套用此法還可比較不同分化細胞里基因表達群在種類和水平上的差異。微陣列法: 此法是將生物的mRNA反轉錄成cDNA,並建立CDNA基因文庫(雙鏈CDNA的克隆);然後將這些克隆一個一個地放入9b孔板上(每孔...
第2章 DNA微陣列技術與基因表達譜 第3章 基因表達譜數據挖掘中的模式識別基礎 第4章 基於因子分量分析的基因表達譜特徵提取方法 第5章 基於傅立葉與小波包變換的基因表達譜特徵提取方法 第6章 信息基因的啟發式搜尋算法研究 第7章 基於粗糙集的信息基因選擇方法 第8章 基於基因調控機率模型的基因表達譜數據挖掘...
基因功能研究的方法有:基因的生物信息學分析,基因的時空表達譜分析(mRNA水平的表達譜分析和蛋白質水平的表達譜分析),基因的功能預測(利用生物信息學進行功能學上的預測和從結構學方面預測基因的功能),基因功能的實驗學鑑定和驗證(基因敲除和敲入技術、人工染色體的轉導、反義技術、基因誘捕技術和微陣列分析)等...
由於生物晶片概念是隨著人類基因組的發展一起建立起來的,所以至今為止生物信號平行分析最成功的形式是以一種尼龍膜為基質的“cDNA陣列”,用於檢測生物樣品中基因表達譜的改變。主要類型 目前已有多種方法可以將寡核苷酸或短肽固定到固相支持物上。這些方法總體上有兩種,即原位合成(in situ synthesis)與合成點樣兩種...
公司於1997年開始大規模人類功能基因cDNA的克隆和測序,建立了國內第一個大規模人類基因資料庫,包含有全長人類基因8000多條;建立了國內最早的基因晶片技術平台之一,並成功開發載有18萬個unigene的晶片產品;建立了國內最早的基因檢測技術和服務體系,並開展了大規模健康基因檢測服務。八年來,聯合基因集團科研投入超過5億元...
基因表達分析技術 基因表達分析技術是分析技術。1、轉錄起始位點確定 2、轉錄水平分析 3、轉錄控制元件(啟動子、順式作用原件)4、基因表達產物的組織器官和亞細胞定位
第7章 基因晶片數據分析技術 113 7.1 基因表達數據的獲取 113 7.1.1 cDNA 微陣列 114 7.1.2 寡核苷酸晶片 116 7.1.3 基因表達數據的網路資源 116 7.2 基因表達數據預處理 118 7.3 基因表達差異的顯著性分析 121 7.3.1 倍數分析 121 7.3.2 t檢驗 121 7.3.3 貝葉斯分析 122 7.4 基因表達...
木質素中擁有聯苯結構的化合物是最難被降解的成分,本人利用Sphingobium在國際上首次闡明了這種聯苯化合物的代謝途徑,並克隆了相關基因。為從再生資源木質素中提取芳香族化合物,改善人類對石化資源的高度依賴,奠定了基礎。海洋微生物資源開發研究:目標是海洋微生物資源的開發利用。本人從各地海洋中收集分離出400多種微...
10. 王紅,畢勇毅,陶寧,汪春紅,趙職衛,夏穎。基因晶片檢測與苯中毒相關的信號傳導通路中基因的差異表達。中華勞動衛生與職業病雜誌 2005,23(4):252-256 11. 王紅,畢勇毅,陶寧,汪春紅,夏穎,張玲。cDNA微陣列結合聚類分析探討苯中毒免疫相關基因表達譜的改變。中華勞動衛生與職業病雜誌 2005,23(4):260...
1996年起參與人類基因組研究,作為主要人員建立國內最早的大規模cDNA測序與全長克隆技術,自造血乾/祖細胞克隆了300條人類的新基因。建立基因表達譜晶片技術,並開展腫瘤的系統生物學研究,識別與腫瘤的發生髮展和分子分型相關的分子標誌物研究,近年利用基因晶片技術在基因組水平開展中藥效應的機制研究。代表作品是銀杏葉...
檢查近400個BAC克隆,空載率小於3%。這些克隆已經PACK在近500塊384孔板內供長期保存。這項工作為我國在重要經濟動物全基因組高密度物理圖譜這個基因組研究的關鍵領域做出有原創性的突破奠定了堅實基礎。我們正通過雜交篩選、酶切和排列位於綿羊第20號染色體主要組織相容複合體(MHC)區段的BAC克隆,繪製該區段及臨近...
1.cDNA 微陣列基因表達譜遺傳模型構建與分析方法的研究 國家自然科學基金(小額資助) 2005-01-01 - 2005-12-31 2.複雜疾病或性狀的遺傳信息分析 國家高技術研究發展計畫(863) 2002-01-01 - 2005-12-31 3.數量性狀基因定位及遺傳改良新方法的研究 教育部高等學校博士學科點專項科研基金 2001-01-01 - 2003...
《子宮內膜癌分子分類和預測模型的建立》是依託上海交通大學,由萬小平擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 使用cDNA微陣列技術和生物信息學方法研究子宮內膜腺癌的基因表達譜,與腫瘤細胞分化程度、有無腹膜後淋巴結轉移、雌激素受體狀況和患者生存時間進行分析和歸納,以界定先前未被識別的內膜癌亞型(分群探索),建立...
[1] 國家自然科學基金項目“基於約束獨立分量分析的腫瘤DNA微陣列數據分析新算法研究”,2008年1月——2010年12月,研究經費18萬元。[2] 曲阜師範大學博士科研啟動基金項目 “基因表達譜數據生物知識發現算法研究”,2007年7月——2010年7月,研究經費5萬元。獲獎情況 2008年指導全國大學生數學建模大賽,參賽組獲省...
第二節 基因克隆 一、外源DNA片段的獲得 二、目的DNA片段的克隆 三、重組子的篩選與鑑定 第三節 核酸分子雜交 一、固相雜交 二、斑點雜交 三、印跡雜交 四、差異雜交 五、cDNA微陣列雜交 六、寡核苷酸微陣列雜交 七、液相雜交 八、遞減雜交 九、核酸原位雜交 第四節 核酸序列測定 一、概述 二、雙脫氧末端...
而套用這一技術的前提是必須首先獲得優良基因克隆,但目前具有專一抗性的抗病基因數量有限,限制了這一技術的套用。而基因晶片用於水稻抗病相關基因的分離及分析,可方便的獲取抗病基因,產生明顯的社會效益。 在醫藥設計、環境保護、農業等各個領域,基因晶片均有很多用武之地,成為人類造福自身的工具。 經濟前景 美國總統...
孫朝暉,南方醫科大學教授,2009年華南理工大學華博生物製藥研究所博士後科研工作站出站。科研簡介 研究方向 1、微陣列技術的臨床套用性研究 2、病毒功能基因組學研究 學術任職 廣州軍區醫學科學技術委員會醫學檢驗專業組委員,廣東省生物醫學工程學會臨床實驗醫學分會委員、廣東省肝臟病學會委員、廣東省預防醫學會微生物與...
Drew等人利用GeXP多重基因表達分析系統、微陣列晶片法及實時螢光定量法對結腸普通組織、息肉及腫瘤組織的炎症相關基因的表達水平進行了研究,結果表明GeXP表達譜分析法可實現同時對多個基因表達進行定量,相比實時螢光定量PCR方法,它更快速、價格更低,同時多個內參基因能確保基因表達水平的準確性。在心血管疾病方面,也有用...
第8章基因表達數據分析………282 8.1基因表達數據的獲取………283 8.1.1 cDNA微陣列………283 8.1.2寡核苷酸晶片………284 8.1.3基因表達數據的網路資源………285 8.2基因表達數據預處理………286 8.3基因表達差異的顯著性分析………289 8.3.1倍數分析………289 8.3.2 t檢驗………29...
劉曦、劉卓琦、羅達亞(通訊)。基因表達譜微陣列網路資料庫在腫瘤研究中的套用。中國生物化學與分子生物學學報,第32卷,第3期,260-266頁,2016 揭小華、彭雄、肖影群、黃波、羅達亞(通訊)。乳酸脫氫酶編碼基因在腫瘤中表達及其轉錄調控機制的研究進展。腫瘤,第35卷,第11期,1271-1277頁,2015 劉卓琦、萬福...
該技術通過將管家基因(例如GAPDH、α-肌動蛋白基因)的表達水平看作常數以作為參照,不過事實上管家基因的表達水平也可能會有較大差異。PCR產物的濃度通過螢光染料產生的螢光強度進行檢測,螢光水平達到閾值所需要的PCR循環數Ct,用於表征基因初始含量。RNA-seq 單細胞RNA測序技術將得到的RNA轉化為cDNA文庫,通過高通量...