用系統生物學方法對miRNAs介導的癌細胞死亡網路的研究

《用系統生物學方法對miRNAs介導的癌細胞死亡網路的研究》是徐建震為項目負責人,河南工業大學為依託單位的聯合基金項目。

基本介紹

  • 中文名:用系統生物學方法對miRNAs介導的癌細胞死亡網路的研究
  • 依託單位:河南工業大學
  • 項目負責人:徐建震
  • 項目類別:聯合基金項目
科研成果,項目摘要,

科研成果

序號
標題
類型
作者
1
RAID: a comprehensive resource for human RNA-associated (RNA-RNA/RNA-protein) interaction
期刊論文
Li, Kongning|Li, Xia|Xu, Jianzhen|Wang, Dong|
2
在非小細胞肺癌中的miRNA-mRNA 互作網路
期刊論文
Chenyu WANG|Junjian WANG|Dong WANG|Jianzhen XU|
3
Deciphering global signal features of high-throughput array data from cancers
期刊論文
Guo, Zheng|Li, Xia|Xu, Jianzhen|Wang, Dong|
4
Current and Emerging Biomarkers of Cell Death in Human Disease
期刊論文
Bi, Xiaoman|Wang, Hongwei|Xu, Jianzhen|Wang, Dong|
5
Cell Death in Human Health and Disease
期刊論文
Xu Jianzhen|Wang Dong|Ma Wencai|

項目摘要

癌細胞死亡進程受到包括細胞凋亡和自噬等信號途徑的協同調節。採用系統生物學方法分析 miRNAs在癌細胞死亡網路中的分子機制及全局性作用是具有挑戰意義的課題。本研究通過有機整合遺傳變異、轉錄調控、表達譜和蛋白互作譜等各種組學數據,分析調控癌細胞死亡的 miRNAs在調控序列、表達譜關係、靶蛋白互作譜以及靶蛋白功能富集類等多方面的特徵,利用KNN、SVM等各種機器學習及數據融合方法設計預測算法,從系統的角度識別新的死亡相關 miRNAs及其差異化功能。藉助細胞轉染、免疫螢光以及流式細胞檢測等生物學實驗揭示miRNAs在癌細胞死亡進程重要作用。在此基礎上,構建包含多層面信息的、miRNAs介導的細胞死亡調控網路,闡明其中調控規律和特徵。研究結果將有助於理解凋亡與自噬通路協同調控癌細胞死亡的分子機制,為抗癌治療提供理論基礎
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