生物信息學實驗指導及習題集

內容簡介

生物信息學是運用生物學、數學、計算機科學等多學科技術與手段進行生物信息的獲取、存儲、分析、利用的一門交叉學科，是目前生物學研究的熱門領域之一。本書主要介紹生物信息學的相關實驗，並給出對應的習題。全書分為四篇：第一篇講解生物信息學實驗，共設計了23個實驗；第二篇為習題集；第三篇為習題集參考答案；第四篇提供相關的名詞解釋。本書附錄部分介紹了常見的模式生物和熱帶植物的主要特點，可供學習生物信息學的讀者鞏固所學的生物信息學知識，並拓展其視野。本書的內容主要對應《實用生物信息學》一書，同時兼顧其他優秀的生物信息學教材。

圖書目錄

第一篇生物信息學實驗 1

第0章生物信息學實驗室規則與安全 2

第1章文獻檢索 3

實驗1 中文文獻檢索(以中國知網資料庫為例) 4

實驗2 外文文獻檢索(以ScienceDirect資料庫為例) 8

第2章生物信息資料庫資源 12

實驗3 核酸資料庫檢索(以GenBank資料庫為例) 13

實驗4 蛋白質資料庫檢索(以UniProt資料庫為例) 22

實驗5 蛋白質結構資料庫檢索(以PDB資料庫為例) 30

實驗6 基因組資料庫檢索(以TAIR資料庫為例) 33

實驗7 代謝資料庫檢索(以KEGG資料庫為例) 38

實驗8 非編碼RNA資料庫檢索(以miRBase資料庫為例) 44

實驗9 基因表達資料庫檢索(以GEO資料庫為例) 47

第3章序列比對 50

實驗10 線上序列比對實驗(以BLAST、BLAT軟體為例) 50

實驗11 本地序列比對實驗(以BioEdit軟體為例) 54

實驗12 多序列比對實驗(以Clustal軟體為例) 57

第4章核酸序列分析 61

實驗13 核酸序列常規分析(以DNAStar軟體為例) 61

實驗14 基因序列元件預測 63

實驗15 引物設計分析(以Primer 5．0軟體為例) 67

實驗16 第一代測序數據分析 71

第5章蛋白質序列分析 75

實驗17 蛋白質理化性質分析 75

實驗18 蛋白質空間結構分析 79

實驗19 蛋白質的修飾分析 82

實驗20 蛋白質定位預測 85

第6章基因表達分析 89

實驗21 qPCR數據分析 89

第7章進化分析 93

實驗22 進化樹構建(以MEGA軟體為例) 93

第8章非編碼miRNA分析 97

實驗23 非編碼miRNA查詢及預測分析 97

第二篇生物信息學習題集 101

第1章文獻檢索 102

1．1 知識點介紹 102

1．2 典型例題講解 103

1．3 習題 105

生物信息學實驗指導及習題集

基本介紹

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