浙江清華長三角研究院分析測試中心建於2014年，為浙江清華長三角研究院直屬機構。由建於2006年的生態環境研究所環境監測研究室和2009年的先進制造所科學儀器研究室合併成立。浙江清華長三角研究院分析測試中心主要針對環境、農產品/食品等主要問題，以分析測試為抓手，套用大數據技術，發展“保全全、促健康”的創新技術體系，在檢驗檢測、風險分析、風險管理、專有檢測儀器和工藝設備等關鍵領域，不斷研發符合社會經濟發展所需的新技術、新產品，加強技術創新與產業的有機結合，促進科技成果向產業轉移。
浙江清華長三角研究院分析測試中心以“國家食品安全風險評估中心套用技術合作中心”、“長三角科學儀器產業技術創新戰略聯盟”和“浙江省科學儀器設備產業技術創新服務平台”為依託，旨在通過集聚整合政府、企業、高校、院所等各方技術資源和創新要素，以市場化運作為導向，立足長三角，面向海內外，努力構建科技創新和產業轉化的有效平台，務求攻關一批環境-食品-大健康等領域檢驗檢測關鍵技術，培養一批創新型、實用型、科研型的高層次專業人才隊伍，促成一批滿足市場和政府管理需求的先進技術成果的產業化，為國家和地區發展提供有效科技服務。
浙江清華長三角研究院分析測試中心擁有50餘人，其中在站博士後1名，博士9人，碩士11人；其中6位具有高級專業技術職稱資格。浙江清華長三角研究院分析測試中心承擔國家、省、市以及企業合作項目100餘項，發明專利20餘項，發表科研論文80餘篇。
浙江清華長三角研究院分析測試中心研發方向：
理化分析測試技術
生物分析測試技術
生態毒理學與食品毒理學
新型感測器和微全分析技術
現代分析儀器技術
物聯網監測系統集成技術
環境-農業-食品的風險分析技術
食品防護關鍵技術
