《水稻生長過程多層次基因調控網路的構建》是依託浙江大學，由陳銘擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名：水稻生長過程多層次基因調控網路的構建
- 依託單位：浙江大學
- 項目負責人：陳銘
- 項目類別：面上項目
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
植物基因型與表型間複雜的相互關係涉及到細胞內多種組分間的時空調控和代謝產物在不同細胞器或組織中的分布，一直是研究人員關注的熱點和難點。本項目以水稻為研究對象，從水稻基因組注釋信息出發，擬利用一個半自動化的流程對現有生物學公共資料庫的信息進行整合，完成水稻基因組尺度的代謝網路的初步構建，並通過系統生物學的方法和實驗手段對網路進行精細的修正和評估。在此基礎上，整合蛋白互作網路、轉錄調控網路的實驗驗證數據與預測數據，完成水稻多層次參考調控網路的初步構建。結合水稻各組織包括根、莖、葉等在生長過程中的基因表達譜數據，利用動態貝葉斯模型，重構水稻生長過程中多層次基因調控網路。本研究將為水稻生物分子間調控機制的研究提供參考，系統促進水稻基因型與表現型間關係的分子機理研究。
結題摘要
本項目通過生物信息學數據挖掘整合與調控網路分析，整合了水稻基因調控網路、蛋白質互作網路和代謝網路等，完成了水稻基因組尺度的多層次調控網路的構建。通過整合水稻不同組織生長過程中的表達譜數據，進行特定組織多層次基因調控網路的構建與分析。完成了水稻基因組水平多基因效應對水稻開花過程的相互作用挖掘；植物生長過程中非編碼表達譜數據的收集及分析鑑定；植物非編碼RNA層次的基因調控網路的研究。並構建了水稻多層次基因調控網路資料庫RiceNetDB，實現多層次調控網路的3D可視化。受項目資助，已發表19篇論文，並開發了多個生物信息學資料庫。參加30多次國內或國際學術會議，培養碩士生2名，博士生6名。
