歐陽鑫昊,男,博士,廈門大學生命科學學院副教授。
基本介紹
- 中文名:歐陽鑫昊
- 畢業院校:四川農業大學
- 學位/學歷:博士
- 職業:教師
- 專業方向:系統生物學與計算生物學
- 任職院校:廈門大學
個人經歷,研究領域,學術成果,
個人經歷
2006年,四川農業大學農學院,學士學位
2011年,四川農業大學,水稻研究所,博士學位
2009-2011年,耶魯大學,分子細胞發育生物學系,訪問博士生
2012-2014年,北京大學-耶魯大學植物分子遺傳及農業生物技術聯合中心,博士後
2012-2015年,四川農業大學,水稻研究所,助理研究員
2015年至今,廈門大學生命科學學院,副教授
研究領域
學術成果
研究手段(Methods)
我們利用CrisprCas9定點突變技術、染色體片段代換及EMS誘變獲得用於基因網路研究的植物遺傳材料。我們通過分子生化實驗、光學顯微鏡、RNA-seq、ChIP-seq等技術收集基因表達、蛋白積累、蛋白-蛋白相互作用、蛋白-DNA相互作用的實驗結果。進一步,我們利用生物信息學方法處理高通量測序數據。最終,我們整合各種實驗數據建立數學模型解析植物基因調控網路的運行機理。
套用(Application)
在水稻育種中,我們發現當改變單個基因獲得某個優良性狀時,往往伴隨著一些不利性狀的產生。而最終優良品種的獲得往往需要多個相關基因共同作用。而我們的研究有助於闡述這些相關基因如何形成調控網路並促進優良品種的形成。最終,我們期望通過基因網路精細調控研究推動分子育種和數值化育種在中國的發展。
學習(Study)
我們推崇“基於項目的學習”的教學手段。在項目的執行過程中,學生利用各種途徑主動學習有利於課題發展的新知識。我們鼓勵學生與其他專業的教授和學生進行深入探討和交流。希望在交流的過程中,學生能夠得到靈感和啟發,並最終完成自己的研究項目。同時,我們歡迎有計算機,數學,物理和化學等相關專業背景的同學加入本實驗室,共同參與植物生物學與多學科交叉的前沿研究。
代表性論文(Selected Publications)
1. Ouyang, X., Huang, X., Jin, X., Chen, Z., Yang, P., Ge, H., Li, S and Deng, X. W. (2014).Coordinated photomorphogenic UV-B signaling network captured by mathematical modeling.Proc Natl Acad Sci USA. Published online July 23 2014.
2 .Ouyang, X., Li, J., Li, G., Li, B., Chen, B., Shen, H., Huang, X., Mo, X., Wan, X., Lin, R., Li, S., Wang, H., Deng,X. W. (2011). Genome-wide binding site analysis of FAR-RED ELONGATED HYPOCOTYL3 reveals its novelfunction inArabidopsisdevelopment.Plant Cell
3. Huang, X.*,Ouyang, X.*, Yang, P.,Lau, O. S.,Li, G., Li, J.,Chen, H.,Deng, X. W. (2012)ArabidopsisFHY3and HY5 positively mediate induction ofCOP1transcription Induction in Response to Photomorphogenic UV-BLight.Plant Cell
4. Zhao, J.*, Huang, X.*,Ouyang, X.*, Chen, W., Du, A., Zhu, L., Wang, S., Deng, X. W., Li, S. (2012)OsELF3-1, an ortholog ofArabidopsis EARLY FLOWERING 3regulates rice circadian rhythm and photoperiodic flowering.PLoS ONE7,
5. Huang, X.,Ouyang, X.& Deng, X. W. Beyond repression of photomorphogenesis: role switching ofCOP/DET/FUS in light signaling.CurrOpin Plant Biol,
6. Huang, X.,Yang, P.,Ouyang, X., Deng, X. W. (2014) Photoactivated UVR8-COP1 Module DeterminesPhotomorphogenic UV-B Signaling Output inArabidopsis.PLoS Genet1
7. Huang, X.,Ouyang, X., Yang, P.,Lau, O. S., Chen, L., Wei, N.,Deng, X. W.(2013) Conversion from CUL4-based COP1-SPA E3 apparatus to UVR8-COP1-SPA complexes underlies a distinct biochemical function ofCOP1under UV-B.Proc Natl Acad Sci USA
8. Li, G., Siddiqui, H., Teng, Y., Lin, R., Wan, X.Y., Li, J., Lau, O.S.,Ouyang, X., Dai, M., Wan, J., Devlin, P.F.,Deng, X.W., and Wang, H.(2011). Coordinated transcriptional regulation underlying the circadian clock inArabidopsis.Nat Cell Biol
9. Fu, C.,Yang, X.O., Chen, X., Chen, W., Ma, Y., Hu, J., and Li, S.(2009). OsEF3, a homologous gene ofArabidopsisELF3, has pleiotropic effects in rice.Plant Biol (Stuttg)