東北師範大學自然博物館暨吉林省自然博物館始建於1987年7月20日，原隸屬於吉林省文化廳，為吉林省唯一省級自然博物館。2001年1月1日，吉林省政府為讓自然博物館獲得更好發展並發揮更大功能，決定將吉林省自然博物館整建制地劃給東北師範大學，並且每年仍由省財政對自然博物館進行全額撥款，而且決定為建設新館投資4000萬元，另由東北師範大學投資5300萬元，總投資達9000多萬元人民幣建設自然博物館新館。新館建設是吉林省“十五”計畫重點項目之一，場館占地面積4公頃，建築面積14700平方米，展廳面積6000平方米，庫房面積3000平方米。建築工程於2006年9月10日竣工，展覽於2007年5月1日布置完畢，並隨即向社會開放。
