會計系統論是一種具有科學方法論性質的現代化管理方法，指運用系統論的原理來研究經營管理過程中出現的問題，以實現計畫與控制最最佳化的會計理論。系統論套用到經營管理中稱為“經營管理系統工程(分析)”。它要求將企業管理活動和管理部門分為垂直分系統和水平分系統，對作為垂直分系統的財務活動要建立相應的會計管理系統，對作為協調各垂直分系統的水平分系統，則要設定水平層次不同的管理階層。
每一層次應有相應的會計人員進行工作：如在廠級管理層，要設定總會計師協助廠長進行工作;在車間管理層，則應有相當會計師水平的人員協助車間主任工作。按照資訊理論，把企業的管理過程視為一種接收、變換、存貯和運輸信息的過程，從一定意義上說，會計工作就是處理會計信息的工作，通過制定會計信息流程，建立信息處理模型和事件，以及組織會計信息的驗收、貯存、轉換、輸送、審查等活動，對經濟業務進行調節、指導和監督。
