昌吉學院圖書館前身是一九五九年成立的昌吉師範學校圖書室,一九八一年昌吉師範學校與昌吉州教育學院合署辦學,一九八六年五月,升格為昌吉師範專科學校,於一九八七年四月正式設立圖書館機構和編制,一九九八年十一月圖書館樓建成;二00一年五月,由昌吉師範專科學校與昌吉州教育學院、昌吉師範學校合併成立昌吉學院,三校圖書館隨之合併。目前,由北校區圖書館樓、南校區分館組成,總面積6300平方米,設有8個流通書庫、4個閱覽室,閱覽座位588個,提供圖書外借、報刊閱覽、參考諮詢、文獻複製、資料庫檢索等服務。
我館擁有比較豐富的館藏資源,截止到2010年12月,我院圖書館館藏印刷型圖書文獻512771冊、外文原版圖書1013冊、電子圖書94508冊,各系資料室藏書48282冊。圖書館每年訂購紙質中文圖書10萬冊,中文期刊700餘種。目前,已初步形成了一個以本校重點學科為主,各學科共同發展,網路資源占有一定優勢的館藏體系。